[发明专利]一种长杂谷2922种子纯度的InDel标记引物对及其鉴定方法和应用在审
申请号: | 202310657232.3 | 申请日: | 2023-06-05 |
公开(公告)号: | CN116516055A | 公开(公告)日: | 2023-08-01 |
发明(设计)人: | 王智兰;杜晓芬;王军;韩康妮;李禹欣;成锴;连世超;李颜方;张林义 | 申请(专利权)人: | 山西农业大学谷子研究所(山西省农业科学院谷子研究所) |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6858 |
代理公司: | 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) 61223 | 代理人: | 崔瑞迎 |
地址: | 046011 山西*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 长杂谷 2922 种子 纯度 indel 标记 引物 及其 鉴定 方法 应用 | ||
1.一种长杂谷2922种子纯度的InDel标记引物对,其特征在于,所述标记引物对包括上游引物InDel Re2632F和下游引物InDel Re2632R;
所述上游引物InDel Re2632F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述下游引物InDel Re2632R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.一种采用权利要求1所述的InDel标记引物对鉴定谷子杂交种长杂谷2922种子纯度的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1,提取样本基因组DNA;
S2,利用InDel标记引物对样本基因组DNA进行PCR扩增;
S3,将S2中获得的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测;
S4,分析S3中的检测结果,杂交种子判断标准为,可以同时扩增出两个亲本特异性序列,然后根据统计结果计算杂交种子纯度,计算公式为:杂合带型数量/有效扩增条带数量*100%。
3.根据权利要求2所述的鉴定谷子杂交种长杂谷2922种子纯度的方法,其特征在于,S1中,样本基因组DNA的提取过程为:叶片液氮速冻后研磨,加入30μL核酸释放剂,离心,将离心后的样品于沸水中煮3-5min,然后将样品离心,吸取上清液,加入无菌水后-20℃保存备用。
4.根据权利要求2所述的鉴定谷子杂交种长杂谷2922种子纯度的方法,其特征在于,S2中,PCR扩增体系为:5.0μL 2×Lightning Taq PCR Mix,1.0μL正向引物,1.0μL反向引物,1.0μL DNA模板,2.0μL灭菌水;
所述的正向引物和反向引物的浓度均为2.0μmol L-1。
5.根据权利要求2所述的鉴定谷子杂交种长杂谷2922种子纯度的方法,其特征在于,S2中,PCR扩增程序为:94℃预变性3min,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸45s,35个循环后,72℃终延伸10min。
6.根据权利要求2所述的鉴定谷子杂交种长杂谷2922种子纯度的方法,其特征在于,S4中,能够同时扩增出序列如SEQ ID NO.3所示的母本特异性序列和序列如SEQ ID NO.4所示的父本特异性序列的样本则为杂交种。
7.一种权利要求1所述的长杂谷2922种子纯度的InDel标记引物对在种子纯度鉴定中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,纯度鉴定样本为长杂谷2922。
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