[发明专利]基于MassARRAY核酸质谱技术的高血压精准用药的基因检测物及应用在审

专利信息
申请号: 202310299931.5 申请日: 2023-03-25
公开(公告)号: CN116463410A 公开(公告)日: 2023-07-21
发明(设计)人: 韩丽;张建立;张亚茜 申请(专利权)人: 山西国信凯尔医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;G16H15/00;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京维正专利代理有限公司 11508 代理人: 韩娟
地址: 030000 山西省太原市山*** 国省代码: 山西;14
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摘要:
搜索关键词: 基于 massarray 核酸 技术 高血压 精准 用药 基因 检测 应用
【权利要求书】:

1.一种基于MassARRAY核酸质谱技术的高血压精准用药的基因检测物,其特征在于,所述基因检测物针对高血压用药指导的21个SNP位点,分别为:rs1042714、rs1801253、rs28371725、rs1065852、rs2238032、rs776746、rs10494366、rs12946454、rs1801133、rs5186、rs4344、rs4359、rs1057910、rs1799853、rs16960228、rs4149601、rs7297610、rs4961、rs3892097、rs5065和rs1799752。

2. 根据权利要求1所述的基因检测物,其特征在于,所述基因检测物包括用于扩增21个SNP位点的21对上、下游引物,所述21对上、下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1~42所示。

3.根据权利要求1或2所述的基因检测物,其特征在于,所述基因检测物还包括针对所述21个SNP位点的21条延伸引物,所述21条延伸引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:43~63所示。

4.根据权利要求1所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述21个SNP位点所检测的16个高血压用药指导相关的基因分别为:ADRB1、ADRB2、CYP2D6、CYP3A5、CACNA1C、NOS1AP、PLCD3、ACE、MTHFR、AGTR1、CYP2C9、PRKCA、NEDD4L、YEATS4、ADD1和NPPA。

5.一种基于MassARRAY核酸质谱技术的用于高血压精准用药的基因检测试剂盒,其特征在于,所述基因检测试剂盒包括如权利要求1-4中任意一项所述的基因检测物。

6.根据权利要求5所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括用于对待测样本中的21个SNP位点进行多重PCR扩增的PCR扩增试剂,对多重PCR扩增后的扩增产物进行去磷酸化的去磷酸化试剂,以及对去磷酸后的扩增产物进行单碱基延伸的延伸试剂;其中,所述PCR扩增试剂中含有所述基因检测物中的21对上、下游引物,所述延伸试剂中含有所述基因检测物中的21条延伸引物。

7.根据权利要求6所述的基因检测试剂盒,其特征在于,利用所述试剂盒对待测样本进行高血压精准用药检测的方法包括如下步骤:

S1,将待测样本的基因组DNA溶液与所述PCR扩增试剂混合形成PCR反应体系,对所述PCR反应体系进行多重PCR扩增,获得扩增产物;

S2,采用所述去磷酸化试剂对所述扩增产物进行去磷酸化,获得去磷酸后的扩增产物;

S3,将所述去磷酸后的扩增产物与所述延伸试剂混合形成延伸反应体系,对所述延伸反应体系进行单碱基延伸,获得延伸产物;

S4,采用脱盐树脂对所述延伸产物进行脱盐纯化,获得纯化后的延伸产物;

S5,将所述纯化后的延伸产物进行芯片点样,然后利用MassARRAY核酸质谱平台对所述纯化后的延伸产物中的21个SNP位点进行检测,获得基因分型结果;

S6,根据获得的基因分型结果生成高血压精准用药报告结果。

8.根据权利要求7所述的基因检测试剂盒,其特征在于,步骤S1中,所述基因组DNA溶液的纯度OD260/OD280为1.8~2.0,优选为1.9~2.0;所述PCR反应体系中每条引物的浓度均为0.4~0.6µM,优选为0.5µM;

步骤S3中,所述延伸反应体系中每条延伸引物的浓度各自独立地为0.56~1.08µM。

9. 根据权利要求7或8所述的基因检测试剂盒,其特征在于,步骤S4中,脱盐纯化过程中,将所述脱盐树脂与所述延伸产物中形成的混合物放置于旋转混匀仪上,在转速为10~15rmp下摇匀30~40min;优选在转速为12 rmp下摇匀40min;

步骤S5中,所述点样的速度为140~160。

10.根据权利要求7或8所述的基因检测试剂盒,其特征在于,步骤S6中,所述高血压精准用药报告结果采用基于python代码编写的自动化报告生成程序自动生成。

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