[发明专利]用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物、试剂盒及设计方法在审
| 申请号: | 202310266401.0 | 申请日: | 2023-03-19 |
| 公开(公告)号: | CN116042865A | 公开(公告)日: | 2023-05-02 |
| 发明(设计)人: | 朱牧孜;李红东;邓波;王鸿;付小妮;范亮波;马西亚;郭晓荣 | 申请(专利权)人: | 西安天隆科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/6858;C12Q1/6811 |
| 代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 胡东东 |
| 地址: | 710018 陕西省西安市经济技*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 人类 cyp2d6 基因 引物 组合 试剂盒 设计 方法 | ||
1.一种用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述引物组合物用于特异性扩增CYP2D6基因的SNP位点,所述引物组合物包括野生型引物、突变型引物和公用引物,所述公用引物用于区分与CYP2D6基因高度同源的CYP2D7和CYP2D8P基因。
2.如权利要求1所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述CYP2D6基因的SNP位点包括c.1846GA、c.100CT、c.1758GA、c.2988GA。
3.如权利要求2所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述公用引物的序列如下:
CYP2D6基因c.1846GA位点:
反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;
CYP2D6基因c.100CT位点:
正向公用引物:GGTGTGTCCAGAGGAGCCCGT;
CYP2D6基因c.1758GA位点:
反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;
CYP2D6基因c.2988GA位点:
反向公用引物:GGCTTACAGGATCCTGGT。
4.如权利要求1所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述野生型引物和突变型引物的错配率为5%-12%。
5.如权利要求2所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述引物组合物的序列如下:
CYP2D6基因c.1846GA位点:
正向野生型引物:CCGTATCTCCCACCCCTAG,
正向突变型引物:CCGTATCTCCCACCCTCAA,
反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;
CYP2D6基因c.100CT位点:
反向野生型引物:GTGGCAGTGGGCCTGTTGG,
反向突变型引物:GGCAGTGGGCCTGGTGAGA,
正向公用引物:GGTGTGTCCAGAGGAGCCCGT;
CYP2D6基因c.1758GA位点:
正向野生型引物:CGCCTTCGCCAACCACTCAG,
正向突变型引物:CCACCTTCGCCAACCACTACA,
反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;
CYP2D6基因c.2988GA位点:
正向野生型引物:GCAGAGGCCGAGGAAGG,
正向突变型引物:TGCAGTGGCCGAGGGTGA,
反向公用引物:GGCTTACAGGATCCTGGT。
6.一种用于人类CYP2D6基因分型检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括上述权利要求1-5任一所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物。
7.如权利要求6所述的用于人类CYP2D6基因分型检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括针对CYP2D6基因的SNP位点的Taqman探针、内标基因的引物和探针、Taq酶、dNTPs、缓冲溶液,所述Taqman探针序列如下:
c.1846GA位点:
探针:ACGCCCCTTTCGCCCCAACG,
c.100CT位点:
探针:TTGGCGCCGGTGCATCAGGTC,
c.1758GA位点:
探针:CTTTGTGCCCTTCTGCCCATCACC,
c.2988GA位点:
探针:TACAGGCGGGGGCCCATGAACTTT。
8.如权利要求7所述的用于人类CYP2D6基因分型检测的试剂盒,其特征在于,所述内标基因为RPPH,RPPH的引物及探针序列如下:
正向引物:TCATCAGTGGGGCCACGA,
反向引物:CTGTTAGGGCCGCCTCTGGC,
探针:TGCGTCCTGTCACTCCACTCCCATGT。
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