[发明专利]用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物、试剂盒及设计方法在审

专利信息
申请号: 202310266401.0 申请日: 2023-03-19
公开(公告)号: CN116042865A 公开(公告)日: 2023-05-02
发明(设计)人: 朱牧孜;李红东;邓波;王鸿;付小妮;范亮波;马西亚;郭晓荣 申请(专利权)人: 西安天隆科技有限公司
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/6858;C12Q1/6811
代理公司: 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 代理人: 胡东东
地址: 710018 陕西省西安市经济技*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 用于 人类 cyp2d6 基因 引物 组合 试剂盒 设计 方法
【权利要求书】:

1.一种用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述引物组合物用于特异性扩增CYP2D6基因的SNP位点,所述引物组合物包括野生型引物、突变型引物和公用引物,所述公用引物用于区分与CYP2D6基因高度同源的CYP2D7和CYP2D8P基因。

2.如权利要求1所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述CYP2D6基因的SNP位点包括c.1846GA、c.100CT、c.1758GA、c.2988GA。

3.如权利要求2所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述公用引物的序列如下:

CYP2D6基因c.1846GA位点:

反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;

CYP2D6基因c.100CT位点:

正向公用引物:GGTGTGTCCAGAGGAGCCCGT;

CYP2D6基因c.1758GA位点:

反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;

CYP2D6基因c.2988GA位点:

反向公用引物:GGCTTACAGGATCCTGGT。

4.如权利要求1所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述野生型引物和突变型引物的错配率为5%-12%。

5.如权利要求2所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物,其特征在于,所述引物组合物的序列如下:

CYP2D6基因c.1846GA位点:

正向野生型引物:CCGTATCTCCCACCCCTAG,

正向突变型引物:CCGTATCTCCCACCCTCAA,

反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;

CYP2D6基因c.100CT位点:

反向野生型引物:GTGGCAGTGGGCCTGTTGG,

反向突变型引物:GGCAGTGGGCCTGGTGAGA,

正向公用引物:GGTGTGTCCAGAGGAGCCCGT;

CYP2D6基因c.1758GA位点:

正向野生型引物:CGCCTTCGCCAACCACTCAG,

正向突变型引物:CCACCTTCGCCAACCACTACA,

反向公用引物:TCCAGCCCCGGCACCTCACG;

CYP2D6基因c.2988GA位点:

正向野生型引物:GCAGAGGCCGAGGAAGG,

正向突变型引物:TGCAGTGGCCGAGGGTGA,

反向公用引物:GGCTTACAGGATCCTGGT。

6.一种用于人类CYP2D6基因分型检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括上述权利要求1-5任一所述的用于人类CYP2D6基因分型的引物组合物。

7.如权利要求6所述的用于人类CYP2D6基因分型检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括针对CYP2D6基因的SNP位点的Taqman探针、内标基因的引物和探针、Taq酶、dNTPs、缓冲溶液,所述Taqman探针序列如下:

c.1846GA位点:

探针:ACGCCCCTTTCGCCCCAACG,

c.100CT位点:

探针:TTGGCGCCGGTGCATCAGGTC,

c.1758GA位点:

探针:CTTTGTGCCCTTCTGCCCATCACC,

c.2988GA位点:

探针:TACAGGCGGGGGCCCATGAACTTT。

8.如权利要求7所述的用于人类CYP2D6基因分型检测的试剂盒,其特征在于,所述内标基因为RPPH,RPPH的引物及探针序列如下:

正向引物:TCATCAGTGGGGCCACGA,

反向引物:CTGTTAGGGCCGCCTCTGGC,

探针:TGCGTCCTGTCACTCCACTCCCATGT。

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