[发明专利]谷子刚毛长短相关的分子标记及相关生物材料和应用

说明书

本发明公开了谷子刚毛长分子标记及相关生物材料和应用。本申请要解决的技术问题是如何提供一种谷子刚毛长短相关的分子标记。本申请提供了检测所述InDel分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短或制备鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品或谷子育种或制备谷子育种产品中的应用。通过鉴定InDel分子标记基因待检植株InDel分子标记基因位点单倍型或基因型的情况来鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短。

技术领域

本申请具体涉及谷子刚毛长短相关的分子标记及相关生物材料和应用。

背景技术

作物育种一直是作物学家工作的重中之重，但是随着社会发展与人类文明的进步与需求，新的育种要求不断被提出，例如产量、品质、抗逆、田间表现等。其中很多优异农艺性状需要在作物生长后期才可以被直接鉴定，这就增加了相关育种工作周期，耗费更多时间和物资成本，不符合现代作物育种的基本理念及需求。通过田间表型鉴定费时耗力，同时表型易受环境因素不同程度的影响，而某些优异农艺性状往往与遗传片段紧密连锁。所以，开发、利用相关分子标记具有重要应用价值。

相对于表型鉴定，分子标记具有更好的稳定性和遗传性。目前主要分子标记可分为三大类，第一类：以分子杂交为基础的DNA标记技术，如限制性片段长度多态性(Restriction fragment length poly-morphism,RFLP)；第二类：以聚合酶链式反应为基础的各种DNA指纹技术；第三类：新型分子标记，如单核苷酸多态性(Single nucleotidepolymorphism,SNP)、单碱基的颠换、转换、插入/缺失等。利用分子标记辅助育种技术在诸多作物中已经取得了一系列成果，如利用分子标记辅助培育出抗白枯叶病水稻，优质高产抗病杂交稻国稻1号，抗白粉病小麦郑麦835、郑麦863，构建新的光敏型饲草高粱新品种选育体系,选育提高棉花纤维强度品系。利用分子标记辅助育种大大缩短育种周期、提高育种效率、克服传统育种过程中的诸多困难、推动分子精准育种进程，加快育种产业发展。除此之外，新的育种要求不仅体现在对作物产量、抗病、品质、株型及田间表现方面，同时也对作物遗传背景丰度提出了前所未有的关注。

谷子耕作伴随着我国黄河流域人类文明的发展，其曾经很长时期作为我们的主粮作物，当时谷子的种植进入鼎盛期。谷子品种的选育起始于其耕作文明的诞生，尤其是优异品种的培育往往需经历漫长的过程。在此期间，人类针对性的育种选择造成谷子品种的遗传背景越来越窄，这不符合未来育种的发展需求。利用相关分子标记可以直接筛选亲本，丰富遗传多样性，缓解遗传背景变窄压力。分子标记也可以对间接相关性状进行筛选，辅助选择关注的优良性状。但是，利用这些遗传资源的同时，也会伴随不符合目前育种要求的性状。例如，刚毛长短不是影响谷子产量的主要因素，但是其增加了穗部附属物和收获、加工处理的工作量。尤其作为穗部性状影响谷子田间美观性，客观反映了谷子育种水平。

刚毛在谷子驯化及培育过程中明显变短，尤其是近代育种表现出对短刚毛强烈选择。刚毛变短极大提高了谷子品种的田间美观性，体现出谷子育种水平的极大进步。但是，刚毛作为穗部发育结构，表现在谷子生育期晚期，延长了短刚毛优异品种的培育周期。因此，开发、利用、鉴定刚毛长/短的分子标记，可以大大缩短具有短刚毛优异品种的培育周期、降低培育成本。

发明内容

本申请解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长度。

为了解决上述问题，本申请提供了下述应用；

InDel分子标记或检测所述InDel分子标记的物质的下述任一种的应用，所示InDel分子标记是核苷酸序列为序列1的第764位-872位的DNA片段：

A1)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短中的应用；

A2)制备鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品中的应用；

A3)谷子育种中的应用；

A4)制备谷子育种产品中的应用。

本申请中，所述刚毛为果穗刚毛。