[发明专利]谷子刚毛长短相关的分子标记及相关生物材料和应用在审
| 申请号: | 202310227976.1 | 申请日: | 2023-03-10 | 
| 公开(公告)号: | CN116219060A | 公开(公告)日: | 2023-06-06 | 
| 发明(设计)人: | 贾冠清;刁现民;孟强;智慧;汤沙 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 | 
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04 | 
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 | 
| 地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 谷子 刚毛 长短 相关 分子 标记 生物 材料 应用 | ||
1.InDel分子标记或检测所述InDel分子标记的物质的下述任一种的应用,所示InDel分子标记是核苷酸序列为序列1的第763位-872位的DNA片段:
A1)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短中的应用;
A2)制备鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品中的应用;
A3)谷子育种中的应用;
A4)制备谷子育种产品中的应用。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测所述InDel分子标记的物质为P1或P2;
所述P1为下述任一种:
A1)检测基因组中SEQ ID No.2第821位-822位之间是否存在AGCT四碱基的插入的物质;
A2)检测转录组中序列为SEQ ID No.3所示的转录产物第424-425位核苷酸之间是否存在AGCU四碱基的插入的物质;
所述P2为检测单倍型的物质,所述单倍型是谷子一条染色体上A1)所述的InDel。
3.产品,其特征在于,所述产品为P1或P2;
所述P1为含有权利要求1或2所述检测所述InDel分子标记的物质,且可为下述G1)-G3)中的任一种:
G1)检测所述InDel分子标记的产品;
G2)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品;
G3)用于谷子育种的产品;
所述P2为含有权利要求2中所述检测单倍型的物质,或所述检测单倍型的物质,且可为下述J1)-J3)中的任一种:
J1)检测谷子刚毛长短相关的InDel分子标记的产品;
J2)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品;
J3)用于谷子育种的产品。
4.鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的方法,其特征在于,所述方法为鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的方法,包括检测待测谷子中权利要求1或2中所述InDel分子标记的基因型,根据待测谷子的所述基因型鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短:
所述基因型为SEQ ID No.2第821位-822位之间存在AGCT四碱基的插入的纯合型的谷子刚毛长度短于或候选短于所述基因型为SEQ ID No.2第821位-822位之间不存在AGCT四碱基的插入的纯合型的谷子刚毛长度。
5.鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的方法,其特征在于,所述方法为A或B:
所述方法A为鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长度的方法,包括检测待测谷子中权利要求2中所述单倍型,根据所述待测谷子的单倍型鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短:
单倍型SiBL1-1对应的纯合基因型谷子刚毛长度短于或候选短于单倍型SiBL1-2对应的纯合基因型谷子刚毛长度,所述单倍型SiBL1-1为基因组中SEQ ID No.2区域的第821-822位核苷酸之间存在AGCT四碱基的插入;所述倍型SiBL1-2为基因组中SEQ ID No.2区域的第821-822位核苷酸之间不存在AGCT四碱基的插入;
所述方法B为检测转录组中序列为SEQ ID No.3所示的转录产物第424-425位核苷酸之间是否存在AGCU四碱基的插入。
6.根据权利要求1或2所述的应用、权利要求3所述的产品或权利要求4或5所述的方法,其特征在于,所述谷子为谷子纯系或自交系。
7.权利要求4或5所述的方法谷子育种中的应用。
8.根据权利要求1、2或7任一所述的应用、权利要求3所述的产品、权利要求6所述的应用、产品或方法,其特征在于,所述育种的目的包括培育或选育短刚毛长或长刚毛长的谷子。
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