[发明专利]一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法及应用

说明书

本发明涉及动物遗传育种领域，本发明提供了一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法及应用，所述方法包括：测量参考群体的生长性状和抗性性状；对参考群体进行全基因组重测序及SNP分型；针对生长性状和抗性性状进行全基因组关联分析，鉴定与生长性状和抗性性状相关的SNP位点；基于不同的SNP标记数量建立全基因组选择模型；基于最佳全基因组选择模型计算参考群体和验证群体的基因组育种值；根据参考群体和验证群体的基因组育种值计算综合育种值。本发明建立了评估花鲈生长性状和抗性性状协同选育的综合育种值的方法，通过对候选亲鱼的综合育种值进行评估可以挑选出兼具生长和抗性优势的核心育种群体，大大缩短育种年限，具有广阔的应用前景。

技术领域

本发明涉及动物遗传育种领域，特别涉及一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法及应用。

背景技术

花鲈(Lateolabrax maculatus)，隶属鲈形目(Perciformes)、鮨科(Serranidae)、花鲈属(Lateolabrax)，在黄渤海、东海、南海等区域均有分布。近年来，我国花鲈养殖年产量均超过15万吨，位列海水养殖鱼类产量前三位，已成为海水养殖支柱产业。然而，目前花鲈种业体系正面临着空前挑战：缺乏优良花鲈品种，尚未建立科学育种体系，长期近亲繁殖导致种质退化现象已经显现，良种化进程大大落后于其他主要海水养殖鱼类。因此急需针对花鲈养殖产业关注的经济性状，开展遗传选育工作。

鱼类育种的首要目标性状是生长性状，提高生长率，培育快速生长品种，可缩短养殖周期和成本，有效提高经济效益；此外，抗性性状也是育种工作关注的焦点，例如耐低氧、耐温、耐盐碱、抗病等都是显著影响养殖产业高质量发展的重要经济性状。目前，往往采用传统选育方式针对鱼类的单一性状进行遗传改良，难以满足花鲈遗传育种要求。

发明内容

鉴于此，本发明提出一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法及应用，旨在解决背景技术中所提到的问题。

本发明将全基因组选择技术(GS)应用于花鲈的遗传育种中，首次建立了评估生长和抗性性状协同选育的综合育种值的方法。通过此方法对候选亲鱼的综合育种值进行评估可以挑选出兼具生长和抗性优势的核心育种群体，大大缩短育种年限，同时也为其他鱼类的多性状复合选育提供借鉴，具有广阔的应用前景。

本发明的技术方案是这样实现的：

一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，包括以下步骤：

S1、测量参考群体的生长性状和抗性性状；

S2、对参考群体进行全基因组重测序及SNP分型；

S3、针对生长性状和抗性性状进行全基因组关联分析，鉴定与生长性状和抗性性状相关的SNP位点；

S4、基于不同的SNP标记数量建立全基因组选择模型；

S5、基于最佳全基因组选择模型计算参考群体和验证群体的基因组育种值；

S6、根据参考群体和验证群体的基因组育种值计算综合育种值。

进一步的，所述方法还包括：

根据基因组育种值与实际表型的相关性评估全基因组选择模型的预测准确性，选取最佳全基因组选择模型。

进一步的，S1步骤中，所述测量参考群体的生长性状和抗性性状的具体步骤包括：先对参考群体进行暂养驯化，暂养期间正常投喂；而后选取体质健壮、摄食状况良好的个体，给予胁迫因子处理，经环境胁迫死亡后记录其生长指标和死亡时间，分别作为生长和抗性性状的表型。更进一步的，所述暂养驯化时间为2周以上，所述胁迫因子为使用碳酸盐水体(26.16±0.5mmol/L)进行碱度胁迫。

更进一步的，S5步骤中，计算参考群体和验证群体的基因组育种值时基于所述选取最佳全基因组选择模型。