[发明专利]一种大麦SNP分子标记及其应用在审
| 申请号： | 202211639183.2 | 申请日： | 2022-12-20 |
| 公开（公告）号： | CN115896337A | 公开（公告）日： | 2023-04-04 |
| 发明（设计）人： | 郭刚刚;王春超;曹明月;雷雨婷;田冰川;唐顺学 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院作物科学研究所;华智生物技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6874;C12N15/11 |
| 代理公司： | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人： | 罗新 |
| 地址： | 100000 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 大麦 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
本发明公开了一种大麦SNP分子标记及其应用，包括43912个SNP分子标记中的至少一种，所述43912个SNP分子标记的物理位置是基于大麦的参考基因组Morex V3进行序列比对确定的。本发明通过筛选出一套共43912个高质量和高多态性的SNP标记，检测结果准确、重复性和稳定性好，可以有效用于对大麦品种资源进行分子标记指纹分析、对杂交群体后代进行基因型鉴定、对品种真实性进行鉴定、对育种材料遗传背景进行分析和筛选、对农艺性状进行关联分析、对大麦种质资源进行全基因组选择，具有广阔的应用前景。
技术领域
本发明属于分子植物育种领域，具体涉及一种大麦SNP分子标记及其应用。
背景技术
大麦是世界上最古老的种植作物之一，具有食用、饲用、酿造、药用等多种用途。由于大麦可以开发高附加值产品和多元用途食品，具有极高的开发潜力，近些年大麦育种越来越受到重视，尤其是青稞，青稞是大麦的重要变种之一，是藏区立农之本。分子标记(Molecular marker technologies)是大麦分子育种中的重要工具，可加快大麦优异品种培育。
传统分子标记技术，如RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism，限制性片段长度多态性)和SSR(Simple Sequence Repeat，简单序列重复)技术曾在功能基因组研究中发挥着重要作用。但是，传统的分子标记技术存在许多局限性，如通量低、数量少、操作过程繁琐，不能满足大规模商业化育种的需求。
发明内容
本发明旨在至少解决上述现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明提出一种大麦SNP分子标记。
本发明还提出一种具有上述大麦SNP分子标记的基因芯片。
本发明还提出一种具有上述大麦SNP分子标记的试剂盒。
本发明还提出一种上述大麦SNP分子标记、基因芯片和试剂盒的应用。
根据本发明的一个方面，提出了一种大麦SNP分子标记，包括43912个SNP分子标记中的至少一种，所述43912个SNP分子标记的物理位置是基于大麦的参考基因组Morex V3进行序列比对确定的，位点信息具体如下：
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