[发明专利]一种与白皮小麦强性种子休眠相关的CAPS标记及应用

说明书

本发明涉及小麦分子育种领域，公开了一种与白皮小麦强性种子休眠相关的CAPS标记及应用，包括一种与白皮小麦强性种子休眠相关的CAPS标记，其特征在于，所述CAPS标记命名为W1‑7，W1‑7的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示；W1‑7作用于小麦6BL染色体上的主效位点Qphs.ahau‑6B，其中，主效位点Qphs.ahau‑6B位于6BL染色体上574.7Mb‑575.6Mb之间；W1‑7包括带型W1‑7‑a和带型W1‑7‑b。本发明记载的W1‑7标记可用于白皮小麦穗发芽抗性材料筛选和分子辅助育种，为白皮小麦穗发芽抗性材料筛选和分子辅助育种提供一种新思路。

技术领域

本发明涉及小麦分子育种领域，尤其涉及一种与白皮小麦强性种子休眠相关的CAPS标记及应用。

背景技术

小麦收获前穗发芽(pre-harvest sprouting，PHS)是指小麦在收获前若遭遇连阴雨天气或长期处于潮湿环境时，籽粒在穗上发芽的现象，是一种世界性灾害。小麦穗发芽会使籽粒发生一系列的生理生化反应，进而使其中的蛋白质、淀粉等分解，导致小麦出粉率、沉降值等指标降低，极大地降低小麦的营养价值与加工品质，同时也会降低小麦产量与下季播种质量，造成巨大的经济损失。全世界每年因小麦穗发芽导致的经济损失超过10亿美元，日本、英国、德国、瑞典、美国、加拿大、巴西、澳大利亚等国均受到穗发芽危害，其中加拿大与澳大利亚尤为严重。

小麦按种皮颜色的不同可以分为白皮小麦与红皮小麦，相对而言，白皮小麦具有更高的出粉率与更好的口感，受到农民的广泛种植。相对红皮小麦而言，大部分白皮小麦品种休眠水平较低，而休眠水平是穗发芽抗性主要影响因素，因此白皮小麦更易感穗发芽，收获期如遇雨容易出现较大的穗发芽危害。黄淮麦区及长江中下游麦区在小麦收获季节降水较多，白皮小麦的大量种植导致穗发芽灾害逐年加剧。因此，研究小麦抗穗发芽分子机制，培育出休眠水平较高具有穗发芽抗性的优质白皮小麦品种意义重大。

申请人利用全基因组关联分析和QTL定位分析共同在小麦6BL染色体定位到一个与白皮小麦穗发芽抗性相关的新主效位点，命名为Qphs.ahau-6B，在京411×万县白麦子RIL群体中定位于6BL染色体上568.5Mb-575.6Mb之间，区间长度为7.1Mb。基于上述结果，以京411×万县白麦子RIL群体为材料，进行小麦660K芯片开发，把6BL上一个SNP(AX-94514767)开发成CAPS标记W1-7，在京411×万县白麦子RIL群体中精细定位在小麦6BL染色体上的标记EX06323与W1-7之间，物理位置为574.7Mb-575.6Mb，使得QTL区间长度从原来的7.1Mb缩至0.9Mb，能解释9.71％-22.90％的穗发芽表型变异；进一步在京411×万县白麦子RIL群体姊妹系构建的JW120×JW27 F2:3次级群体中将Qphs.ahau-6B进行了验证性定位，连锁标记为W1-7和EX06323，可解释21.20％和22.90％的表型变异。分析W1-7不同带型和穗发芽抗性的关系，发现W1-7-a带型和白皮小麦穗发芽抗性紧密相关。W1-7标记可用于白皮小麦穗发芽抗性材料筛选和分子辅助育种。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的不足，本发明提供一种与白皮小麦强性种子休眠相关的CAPS标记及应用。

本发明采用以下技术方案实现：一种与白皮小麦强性种子休眠相关的CAPS标记，所述CAPS标记命名为W1-7，W1-7的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示；

W1-7作用于小麦6BL染色体上的主效位点Qphs.ahau-6B，其中，主效位点Qphs.ahau-6B位于6BL染色体上574.7Mb-575.6Mb之间；

W1-7包括带型W1-7-a和带型W1-7-b。

优选的，携带W1-7-a带型材料的发芽指数低于携带W1-7-b带型的材料；

携带W1-7-a带型的材料的穗发芽抗性高于携带W1-7-b带型的材料的穗发芽抗性。