[发明专利]基于PEMV-1和PEMV-2侵染性克隆高效筛选抗病毒种质资源的方法在审

专利信息
申请号: 202211567418.1 申请日: 2022-12-07
公开(公告)号: CN115927757A 公开(公告)日: 2023-04-07
发明(设计)人: 陈小姣;陈泓霖;谢敏;兰平秀;谭冠林;李凡 申请(专利权)人: 云南农业大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12N15/84;C12N15/66;C12N7/00;C12R1/94
代理公司: 昆明盛鼎宏图知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 53203 代理人: 王辉
地址: 650201 云*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 基于 pemv 侵染 克隆 高效 筛选 抗病毒 种质 资源 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测PEMV-1的引物,其特征在于,所述引物为:

PEMV-1-801-F:5’-AGTTCGTCCTGGTGTCCTGG-3’;

PEMV-1-801-R:5’-CATACCACTTCCCATCCCGC-3’。

2.一种用于检测PEMV-2的引物,其特征在于,所述引物为:

PEMV-2-483-F:5’-TTCAGGAGCACCCGAAACAC-3’;

PEMV-2-483-R:5’-CGTAGTGAGAGGCATGGCAT-3’。

3.根据权利要求1或2所述的引物,其特征在于,反应体系为:5μL Tap mix、3.6μL ddH2O、0.2μL Primer(For)和0.2μL Primer(Rev),1μL cDNA;

反应程序为:94℃3min;94℃30s,56℃30s,72℃50s,35cycles;72℃5min。

4.一种用于扩增PEMV-1基因组的5′和3′端序列的引物,其特征在于,所述引物为:

PEMV-1 5'RACE-GSP:5'-GCGGTAGTTGAGGCTGCTCAATTCC-3';

PEMV-1 3'RACE-GSP:5'-AGGCCAGGAGTTCTCTGCCTGTGAG-3'。

5.一种用于扩增PEMV-2基因组的5′和3′端序列的引物,其特征在于,所述引物为:

PEMV-2 5'RACE-GSP:5'-TACTGTCAGCATCGCGGCGCGCTCG-3';

PEMV-2 3'RACE-GSP:5'-ACACCCTGCCACGAGGTGCGTGGA-3'。

6.一种用于扩增PEMV-1的方法,其特征在于,将PEMV-1分为三个片段:PEMV-1-1、PEMV-1-2和PEMV-1-3;使用引物组pCB301-PEMV-1-1F/PEMV-1-1R,PEMV-1-2F/PEMV-1-2R和PEMV-1-3F/pCB301-PEMV-1-3R分别扩增PEMV-1的片段PEMV-1-1、PEMV-1-2和PEMV-1-3;

PEMV-1的引物序列如下:

pCB301-PEMV-1-1F:

5’-AGTTCATTTCATTTGGAGAGGGTGAAATAATTGTAAGAAAGCTCTAG-3’;

PEMV-1-1R:

5’-TTGTTACGAATCTTCTCCATCTTATGTGGTTCCAGC-3’;

PEMV-1-2F:5’-GGAACCACATAAGATGGAGAAGATTCGTAACAAGCGC-3’;

PEMV-1-2R:

5’-CGACCGAAAGTGGCAGACCCATTGGAACGA-3’;

PEMV-1-3F:

5’-ATGGGTCTGCCACTTTCGGTCGTGAAATTC-3’;

pCB301-PEMV-1-3R:

5’-GAGATGCCATGCCGACCCTGCGATATAATCCCATGAAAACGCTG-3’;所述方法的PCR扩增体系为20μL:5×PrimeSTAR GXL Buffer 4μL,dNTP mixture(2.5mM each)1.6μL,上游引物0.6μL,下游引物0.6μL,PrimeSTAR GXL DNA Polymerase0.4μL,dd H2O 10.8μL,cDNA 2μL;引物pCB301-PEMV-1-1F/PEMV-1-1R退火温度54.5℃,延伸3min;PEMV-1-2F/PEMV-1-2R退火温度60℃,延伸3min;PEMV-1-3F/pCB301-PEMV-1-3R退火温度60℃,延伸2min;反应程序为:98℃30s;98℃10s,Y℃15s,68℃Zmin;68℃10min;4℃保存。

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