[发明专利]基于PEMV-1和PEMV-2侵染性克隆高效筛选抗病毒种质资源的方法在审
申请号: | 202211567418.1 | 申请日: | 2022-12-07 |
公开(公告)号: | CN115927757A | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 陈小姣;陈泓霖;谢敏;兰平秀;谭冠林;李凡 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12N15/84;C12N15/66;C12N7/00;C12R1/94 |
代理公司: | 昆明盛鼎宏图知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 53203 | 代理人: | 王辉 |
地址: | 650201 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 pemv 侵染 克隆 高效 筛选 抗病毒 种质 资源 方法 | ||
1.一种用于检测PEMV-1的引物,其特征在于,所述引物为:
PEMV-1-801-F:5’-AGTTCGTCCTGGTGTCCTGG-3’;
PEMV-1-801-R:5’-CATACCACTTCCCATCCCGC-3’。
2.一种用于检测PEMV-2的引物,其特征在于,所述引物为:
PEMV-2-483-F:5’-TTCAGGAGCACCCGAAACAC-3’;
PEMV-2-483-R:5’-CGTAGTGAGAGGCATGGCAT-3’。
3.根据权利要求1或2所述的引物,其特征在于,反应体系为:5μL Tap mix、3.6μL ddH2O、0.2μL Primer(For)和0.2μL Primer(Rev),1μL cDNA;
反应程序为:94℃3min;94℃30s,56℃30s,72℃50s,35cycles;72℃5min。
4.一种用于扩增PEMV-1基因组的5′和3′端序列的引物,其特征在于,所述引物为:
PEMV-1 5'RACE-GSP:5'-GCGGTAGTTGAGGCTGCTCAATTCC-3';
PEMV-1 3'RACE-GSP:5'-AGGCCAGGAGTTCTCTGCCTGTGAG-3'。
5.一种用于扩增PEMV-2基因组的5′和3′端序列的引物,其特征在于,所述引物为:
PEMV-2 5'RACE-GSP:5'-TACTGTCAGCATCGCGGCGCGCTCG-3';
PEMV-2 3'RACE-GSP:5'-ACACCCTGCCACGAGGTGCGTGGA-3'。
6.一种用于扩增PEMV-1的方法,其特征在于,将PEMV-1分为三个片段:PEMV-1-1、PEMV-1-2和PEMV-1-3;使用引物组pCB301-PEMV-1-1F/PEMV-1-1R,PEMV-1-2F/PEMV-1-2R和PEMV-1-3F/pCB301-PEMV-1-3R分别扩增PEMV-1的片段PEMV-1-1、PEMV-1-2和PEMV-1-3;
PEMV-1的引物序列如下:
pCB301-PEMV-1-1F:
5’-AGTTCATTTCATTTGGAGAGGGTGAAATAATTGTAAGAAAGCTCTAG-3’;
PEMV-1-1R:
5’-TTGTTACGAATCTTCTCCATCTTATGTGGTTCCAGC-3’;
PEMV-1-2F:5’-GGAACCACATAAGATGGAGAAGATTCGTAACAAGCGC-3’;
PEMV-1-2R:
5’-CGACCGAAAGTGGCAGACCCATTGGAACGA-3’;
PEMV-1-3F:
5’-ATGGGTCTGCCACTTTCGGTCGTGAAATTC-3’;
pCB301-PEMV-1-3R:
5’-GAGATGCCATGCCGACCCTGCGATATAATCCCATGAAAACGCTG-3’;所述方法的PCR扩增体系为20μL:5×PrimeSTAR GXL Buffer 4μL,dNTP mixture(2.5mM each)1.6μL,上游引物0.6μL,下游引物0.6μL,PrimeSTAR GXL DNA Polymerase0.4μL,dd H2O 10.8μL,cDNA 2μL;引物pCB301-PEMV-1-1F/PEMV-1-1R退火温度54.5℃,延伸3min;PEMV-1-2F/PEMV-1-2R退火温度60℃,延伸3min;PEMV-1-3F/pCB301-PEMV-1-3R退火温度60℃,延伸2min;反应程序为:98℃30s;98℃10s,Y℃15s,68℃Zmin;68℃10min;4℃保存。
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