[发明专利]与甜瓜种子重量基因共分离的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种与甜瓜种子重量基因共分离的SNP分子标记，位于甜瓜基因组DHL92 v3.6.1第6号染色体的MELO3C014002基因的启动子核苷酸序列的第35765030至35765356位如SEQ ID NO.1所示，SEQ ID NO.1的第257位为C/T。本发明还提供了一种上述SNP分子标记的检测引物。本发明还提供一种含上述SNP分子标记或检测引物的试剂盒。本发明又提供了一种上述SNP分子标记、检测引物或试剂盒在甜瓜种子重量分子标记辅助育种中的应用，能提高选择的准确性、加快新品种培育的进程。本发明还提供了一种利用上述SNP分子标记、检测引物或试剂盒筛选甜瓜种子重量的方法。

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，具体涉及一种与甜瓜种子重量基因共分离的SNP分子标记及其应用。

背景技术

甜瓜(Cucumis melo L.)是主要的葫芦科蔬菜作物之一，栽培面积广泛，具有重要的经济价值。中国是甜瓜生产大国，甜瓜在果蔬生产中占有重要地位。种子是植物生命的起点和终点，是植物生长发育的重要决定因素。在许多以种子为主要生产器官的作物的驯化和育种过程中，种子重量从理论上反映了种胚所存的物质能量，具有重要的生态指示意义。种子愈重；其活力愈高、出苗迅速整齐、出苗高峰明显；幼苗生长占优势、成苗素质好，因此；在农业生产中，为保证一播全苗和培育壮苗应优选粒大饱满的种子。

目前我国的甜瓜种子生产已基本实现了杂种化，使甜瓜具有较强的杂种优势，因此加大甜瓜种子的生产培育可以推定我国甜瓜产业的进一步发展，所以从分子水平深入研究甜瓜种子的发育机制可以加速甜瓜种子的育种进程。

相对于拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)和小麦(Triticumaestivum)等作物对种子重量的研究，瓜类种子重量基因的QTL定位与克隆研究目前还处于初级阶段，主要集中于对控制种子重量基因进行初步定位与遗传分析方面。根据目前对甜瓜种子重量的研究结果显示，现有技术将甜瓜种子重量定位在12条染色体上，没有一个统一的定位，有关甜瓜种子重量调控基因的精细定位、克隆及其遗传结构研究还未见报道，也未能找到与甜瓜种子重量紧密连锁的分子标记。因此，现有的甜瓜种子重量基因的定位结果难以用于甜瓜的分子育种实践。

发明内容

有鉴于此，本发明确有必要提供一种与甜瓜种子重量基因共分离的SNP分子标记及其应用，以解决上述问题。

具体地，本发明提供一种与甜瓜种子重量基因共分离的SNP分子标记，其中，SNP分子标记位于甜瓜基因组DHL92 v3.6.1第6号染色体的MELO3C014002基因的启动子核苷酸序列的第35765030至35765356位如SEQ ID NO.1所示，SNP位点位于如SEQ ID NO.1所示序列的第257位，且所述SNP位点碱基为C/T。

基于上述，所述SNP位点上，碱基为C时为重甜瓜种子；碱基为T时为轻甜瓜种子。其中，所述重甜瓜种子的千粒重大于17.97g，所述轻甜瓜种子千粒重小于17.97g。

本发明还提供一种与甜瓜种子重量基因共分离的SNP分子标记的检测引物，包括一对检测引物对，正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

本发明还提供一种包含上述检测引物的试剂盒。

本发明还提供一种含上述SNP分子标记或检测引物或试剂盒在甜瓜种子重量分子标记辅助育种中的应用。

本发明还提供一种含上述SNP分子标记或检测引物或试剂盒在鉴定筛选甜瓜种子重量中的应用。

本发明还提供一种筛选甜瓜种子重量的方法，所述方法包含应用所述的SNP分子标记组合、所述的特异性引物或所述试剂盒的步骤。

所述筛选甜瓜种子重量的方法，包括以下步骤：