[发明专利]一种多重qPCR检测细菌的探针引物组、试剂盒以及检测方法有效
申请号: | 202211377448.6 | 申请日: | 2022-11-04 |
公开(公告)号: | CN116121409B | 公开(公告)日: | 2023-10-24 |
发明(设计)人: | 邵阳;刘佳;赵忞超;那成龙;刘思思;崔月利;郭垚;吴卫卫;蒋文 | 申请(专利权)人: | 迪飞医学科技(南京)有限公司;南京迪飞医学检验有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01;C12R1/22;C12R1/385 |
代理公司: | 南京新慧恒诚知识产权代理有限公司 32424 | 代理人: | 邓唯 |
地址: | 210032 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多重 qpcr 检测 细菌 探针 引物 试剂盒 以及 方法 | ||
1.一种多重qPCR检测细菌的探针引物组,其特征在于,用于单反应同时检测鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、嗜麦芽窄食单胞菌和铜绿假单胞菌的四重荧光PCR反应,包括:
用于对鲍曼不动杆菌进行检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ ID NO.1-2所示;
用于对肺炎克雷伯菌进行检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ ID NO.4-5所示;
用于对嗜麦芽窄食单胞菌进行检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ ID NO.13-14所示;
用于对铜绿假单胞菌检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ ID NO.10-11所示。
2.根据权利要求1所述的多重qPCR检测细菌的探针引物组,其特征在于,所述的探针引物组中还包括分别对扩增产物进行报告的探针组合;所述的探针组合包括:
用于对鲍曼不动杆菌扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
用于对肺炎克雷伯菌扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
用于对嗜麦芽窄食单胞菌扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示;
用于对铜绿假单胞菌扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。
3.根据权利要求1所述的多重qPCR检测细菌的探针引物组,其特征在于,所述探针的5’端修饰有报告基团,所述报告基团为FAM、HEX、ROX和Cy5;四种探针采用不同的报告基团修饰。
4.根据权利要求3所述的多重qPCR检测细菌的探针引物组,其特征在于,所述探针的3’端修饰有淬灭基团,所述猝灭基团为BHQ1和BHQ2;SEQ ID NO.3所示核苷酸序列与SEQ IDNO.6所示核苷酸序列采用淬灭基团BHQ1修饰,SEQ ID NO.15所示核苷酸序列与SEQ IDNO.12所示核苷酸序列采用淬灭基团BHQ2修饰。
5.一种多重定量PCR检测细菌的方法,其特征在于,其采用上述的探针引物组进行多重定量PCR反应对鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、嗜麦芽窄食单胞菌和铜绿假单胞菌进行鉴定。
6.根据权利要求5所述的多重定量PCR检测细菌的方法,其特征在于,包括如下步骤:1)从样品中提取核酸;2)以提取的核酸为模板,用探针引物组进行多重荧光定量PCR扩增反应并收集荧光信号;3)根据荧光信号判定样品中是否含有鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、嗜麦芽窄食单胞菌和铜绿假单胞菌。
7.根据权利要求6所述的多重定量PCR检测细菌的方法,其特征在于,所述的样本包括但不限于肺泡灌洗液、痰液、血液、脑脊液、心包积液、胸水、尿液、脓液、拭子和组织等。
8.根据权利要求5所述的多重定量PCR检测细菌的方法,其特征在于,上述步骤2)中的多重荧光定量PCR扩增反应体系为:
多重荧光qPCR扩增反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性15s,58.5℃退火30s,共45个循环。
9.一种试剂盒,其特征在于,其中包含有权利要求1或2所述的探针引物组。
10.权利要求1或2所述的探针引物组在制备四重荧光PCR反应检测鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、嗜麦芽窄食单胞菌和铜绿假单胞菌的试剂盒中的用途。
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