[发明专利]荧光定量PCR法鉴别单纯疱疹病毒I型和/或II型的试剂及其应用在审
| 申请号: | 202211197819.2 | 申请日: | 2022-09-29 |
| 公开(公告)号: | CN116287432A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
| 发明(设计)人: | 杨晓明;王辉;邓力;梁宏阳;赵玉秀;李静华;郭苗苗;高文蕊;马天聪 | 申请(专利权)人: | 北京生物制品研究所有限责任公司 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京三友知识产权代理有限公司 11127 | 代理人: | 韩蕾;张德斌 |
| 地址: | 100176 北京市大兴区北京经*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 荧光 定量 pcr 鉴别 单纯 疱疹病毒 ii 试剂 及其 应用 | ||
1.一种检测单纯疱疹病毒的试剂,该试剂包括:
针对单纯疱疹病毒I型US1基因的荧光定量PCR扩增引物;和/或
针对单纯疱疹病毒II型UL26基因的荧光定量PCR扩增引物。
2.根据权利要求1所述的试剂,其中:
针对单纯疱疹病毒I型US1基因的荧光定量PCR扩增引物包括:
上游引物HSV1-US1F:5′-TCTGGGGACCAGGATGAAG-3′
下游引物HSV1-US1R:5′-GACGCATCCGTTTCCGT-3′;
针对单纯疱疹病毒II型UL26基因的荧光定量PCR扩增引物包括:
上游引物HSV2-UL26F:5′-GTTGTTGTTTCTGGTCCGCC-3′
下游引物HSV2-UL26R:5′-GATGCCCCCGAACCAACTTA-3′。
3.根据权利要求1所述的试剂,该试剂还包括:
针对单纯疱疹病毒I型US1基因的荧光定量PCR检测探针;和/或
针对单纯疱疹病毒II型UL26基因的荧光定量PCR检测探针。
4.根据权利要求3所述的试剂,其中:
针对单纯疱疹病毒I型US1基因的荧光定量PCR检测探针包括:
探针HSV1-US1P:5′-TCCGCCGACATGTCCAGAAA-3′;
针对单纯疱疹病毒II型UL26基因的荧光定量PCR检测探针包括:
探针HSV2-UL26P:5′-GGACGTCGGCGGACACACAACA-3′。
5.根据权利要求1所述的试剂,该试剂还包括:
US1基因的阳性质控品;和/或
UL26基因的阳性质控品。
6.根据权利要求5所述的试剂,其中:
US1基因的阳性质控品具有SEQ ID NO:7所示核苷酸序列:
SEQ ID NO:7:GGATTCGACCGAGTCTGGGGACCAGGATGAAGCCCCCCGCATCGGTGGCCGTAGGGCCCCCCGGAGGCTTGGGGGGCGGTTTTTTCTGGACATGTCGGCGGAATCCACCACGGGGACGGAAACGGATGCGTCGGTGTCGGAC;
UL26基因的阳性质控品具有SEQ ID NO:8所示核苷酸序列:
SEQ ID NO:8:AGGGAAGGGTGGGGGTGGTGGTGGTGGGGTGTTTTTCTGTTGTTGTTGTTTCTGGTCCGCCTGGTCACAAAAGGCACGGCGCCCCGAAACGCGGGCTTTAGTCCCGGCCCGGACGTCGGCGGACACACAACAACGGCGGGCCCCGTGGGTGGGTAAGTTGGTTCGGGGGCATCGCTGTATTCCCTTGCCCGCTTCCACCCCCCCTTCCCGTTTGGTTTGTTTGTGCGGGTGCCCATGGCGTC。
7.一种检测单纯疱疹病毒的试剂盒,该试剂盒包括:权利要求1-6任一项所述的试剂;
优选地,所述试剂盒还包括:2×PCR预混液、DNase/RNase-Free去离子水中的一种或多种。
8.一种非诊断目的的检测单纯疱疹病毒的方法,该方法包括:
利用权利要求1-6任一项所述的试剂,对待测样品进行荧光定量PCR检测。
9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述荧光定量PCR为两重荧光定量PCR,该方法用于鉴别待测样品中是否含有单纯疱疹病毒I型和/或单纯疱疹病毒II型;
优选地,PCR反应体系为20μL,包含10μL qPCR预混液和4μL的模板,各引物终浓度为0.2~0.4μM,各探针的终浓度为0.1~0.2μM,余量为无菌无酶水;
更优选地,PCR反应程序为:50℃,2min,94℃预变性10min,94℃变性15s,58~60℃退火50~60s,40~45个循环。
10.根据权利要求8或9所述的方法,其中,核酸样本扩增曲线呈S型且Ct值38,判断为阳性;
优选地,所述方法进一步包括根据标准曲线计算病毒载量。
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