[发明专利]一种检测双链DNA错配类型及位置的方法在审

专利信息
申请号: 202211026514.5 申请日: 2022-08-25
公开(公告)号: CN115927544A 公开(公告)日: 2023-04-07
发明(设计)人: 王家海;陈达奇;黄晓青 申请(专利权)人: 广州大学
主分类号: C12Q1/6825 分类号: C12Q1/6825;G01N27/26
代理公司: 广州高炬知识产权代理有限公司 44376 代理人: 孔令环
地址: 510006 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 dna 类型 位置 方法
【权利要求书】:

1.一种检测双链DNA错配类型及位置的方法,其特征在于,其包括如下步骤:将双链DNA样品以及可与特定类型碱基错配位点选择性结合的配体结合后,通过α-溶血素纳米孔检测平台检测所述双链DNA样品与所述配体结合前后的热稳定性差异指标,得到所述双链DNA的错配碱基类型与位置信息。

2.根据权利要求1所述的检测双链DNA错配类型及位置的方法,其特征在于,所述特定类型碱基错配位点包括G-G、G-T、G-A、C-C、A-A、T-T、C-A、C-T或T-C。

3.根据权利要求1所述的一种检测双链DNA错配类型及位置的方法,其特征在于,所述特定类型碱基错配位点为G-G时,所述配体为2-氨基-1,8-萘啶二聚体。

4.根据权利要求1所述的检测双链DNA错配类型及位置的方法,其特征在于,所述热稳定性差异指标为所述双链DNA通过所述α-溶血素纳米孔时的解旋时间。

5.根据权利要求4所述的检测双链DNA错配类型及位置的方法,其特征在于,所述解旋时间包括每个易位事件的停留时间和/或阻断电流。

6.根据权利要求1所述的检测双链DNA错配类型及位置的方法,其特征在于,所述α-溶血素纳米孔的制备方法包括以下步骤:

将溶解在癸烷中的二苯基磷脂酰胆碱加入双层室中,在孔口处注入电解质溶液,通过DPhPC形成平面脂质双层膜,将α-HL蛋白添加到cis腔中,cis腔连接到“地”,通过两个Ag/AgCl电极,在两个腔室之间施加200mV的电压,待蛋白质运动至插入到磷脂双分子层中制得。

7.根据权利要求1所述的检测双链DNA错配类型及位置的方法,其特征在于,所述热稳定性差异指标的检测方法包括以下步骤:

将双链DNA或其与配体的混合物添加到cis室,用膜片钳放大器记录电流的变化,得到易位信号峰的数据,将易位信号的持续时间规律进行统计,得到双链DNA的错配碱基与位置信息。

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