[发明专利]一种精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记及应用

权利要求书

1.一种精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记，其特征在于，所述分子标记位于SEQID NO：1所示核苷酸序列的第395位，具有G/T多态性。

2.根据权利要求1所述的精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记，其特征在于，所述分子标记的基因型为GG、TT和GT。

3.根据权利要求1所述的精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记，其特征在于，

所述分子标记的基因型为GG的毛白杨个体，春季萌芽时间较晚，

所述分子标记的基因型为TT的毛白杨个体，春季萌芽时间较早；

所述分子标记的基因型为GT的毛白杨个体，春季萌芽时间适中。

4.一种权利要求1至3之一所述分子标记的获得方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

步骤1，获得毛白杨群体的表型性状；

步骤2，获得与毛白杨春季萌芽时间相关的分子标记；

其中，步骤2包括以下子步骤：

步骤2-1，对毛白杨群体中每个个体的DNA进行重测序，将获得的原始数据进行质量控制；

步骤2-2，在全基因组水平鉴定单核苷酸多态性位点及其基因型；

步骤2-3，对全基因组水平SNPs进行筛选，获得高质量SNPs标记集合；

步骤2-4，获得与毛白杨春季萌芽时间显著相关的SNP标记。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述方法还包括步骤2-5，对获得的显著关联的SNP标记进行选择性清除分析。

6.权利要求1至3之一所述精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记或权利要求4所述方法获得的分子标记在如下(1)至(3)任一方面中的应用：

(1)预测毛白杨春季萌芽时间；(2)毛白杨分子标记辅助育种；(3)毛白杨的种质选育。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述应用包括对毛白杨基因组DNA进行PCR扩增、并确定毛白杨权利要求1至3之一所述分子标记的基因型的步骤，

优选地，所述PCR扩增采用的引物对包括引物P1和引物P2，

引物P1包括如SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列，引物P2包括如SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列。

8.鉴定或者辅助鉴定毛白杨春季萌芽时间的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

步骤I，提取待测毛白杨的基因组DNA；

步骤II，以上述提取的基因组DNA为模板，进行PCR扩增；

步骤III，确定待测毛白杨上述SNP分子标记的基因型；

步骤IV，根据基因型结果确定待测毛白杨的春季萌芽时间。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤IV中，所述分子标记的基因型为GG的毛白杨个体，春季萌芽时间较晚，所述分子标记的基因型为TT的毛白杨个体，春季萌芽时间较早；所述分子标记的基因型为GT的毛白杨个体，春季萌芽时间适中。