[发明专利]一种与甜瓜单果重性状主效QTL-sfw2.2紧密连锁的分子标记及其应用

说明书

一种与甜瓜单果重性状主效QTL‑sfw2.2紧密连锁的分子标记及其应用，属于植物分子遗传育种研究领域。将该分子标记在若干个甜瓜自然群体中进行单果重性状检测，用待选材料DNA为模板，分子标记BCYIndel13的引物对其进行PCR扩增，将扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳并结合田间性状分析，分子标记苗期鉴定准确率为90.0％。本发明分子标记在甜瓜生产实践、育种中具有非常重要的价值。操作方法简便，稳定性高，快速且准确，为甜瓜分子育种提供了辅助选择的新方法。

技术领域

本发明属于植物分子遗传育种研究领域，具体涉及一种与甜瓜单果重性状主效QTL-sfw2.2紧密连锁的分子标记及其应用，可用于甜瓜单果重性状苗期分子标记辅助育种。

背景技术

甜瓜(Cucumis melo L.)是葫芦科主要的经济植物，富含多种营养元素，在中国各地和世界温带至热带地区被广泛栽培。农业生产上的甜瓜，其果实大小是连续变化的，它的生长发育程度易受到光照、土壤等生理环境的影响，并且后代会出现不同于亲本大小的情况。果实过小会导致甜瓜产量减少，影响生产者的收益和消费者的消费体验；果实过大会导致采收时投入的人力物力加大，销售时运输困难，人们购买后食用不完而造成浪费。通过对甜瓜单果重性状的研究，不仅能培育出既保证生产者收益不被影响又能适合消费者需求的甜瓜新品种，还可以筛选出现有甜瓜果型过重或过轻的品种，达到种植单果重适中的甜瓜品种的目的，减少农民的生产成本，提高产量和经济效益，因此通过构建遗传连锁图谱对甜瓜单果重性状基因进行定位，获得单果重相关性状连锁的分子标记，为甜瓜苗期分子标记辅助选择育种提供理论依据，为与甜瓜单果重相关的基因挖掘和功能分析提供基础。

国内外研究学者围绕作物单果重性状的遗传分析和QTL定位做了大量研究，传统遗传学研究结果表明，作物单果重性状是由多基因遗传控制的数量性状，受环境因素的影响较大。早期由于技术的不完善，只对少数定位的单果重性状QTL进行了解析，后来随着分子标记技术、QTL定位方法及相关物种基因组测序的发展，进一步加速了作物单果重性状QTL的解析。Indel(Insertion-deletion)标记是一种以PCR技术为手段扩增的分子标记，它的本质是一种长度多态标记。在分布上，Indel标记的分布强度远远超过SSR标记，且具有稳定性好、多态性高、分布广泛、容易识别和分类等特点。目前，Indel分子标记已被广泛的应用于作物遗传特性分析和植物分子育种。

发明内容

本发明的目的是提供一种高效鉴定甜瓜单果重性状的分子标记，所述分子标记能够用于甜瓜重果型或过轻品种的快速鉴定，分子标记苗期鉴定准确率为90.0％。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的：

一种与甜瓜单果重性状主效QTL-sfw2.2紧密连锁的分子标记，其引物序列为：

BCYIndel13F：TGCTTTTCTAAAGACCCTTAGTACA，

BCYIndel13R：ATCCCTATCCACCACTACATTTACT。

一种上述的分子标记BCYIndel13的应用，所述分子标记BCYIndel13用于甜瓜苗期分子标记辅助育种。

进一步地，所述应用为：将该分子标记在若干个甜瓜自然群体中进行单果重性状检测，用待选材料DNA为模板，分子标记BCYIndel13的引物对其进行PCR扩增，将扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳并结合田间性状分析，分子标记苗期鉴定准确率为90.0％。

BCYIndel13的引物与DNA碱基结合，并且应该在特定的位点结合，说明具有控制该性状的潜在基因型；能够结合，或者结合之后不在特定的位点，都没有控制单果重(大或者小)的基因，(或者该基因不表达)，均不具有这个性状。

进一步地，所述分子标记方法为：