[发明专利]全雌性型节瓜的KASP分子标记、引物及筛选方法

说明书

本发明公开了一种节瓜全雌性型的KASP分子标记、引物及筛选方法，所述KASP分子标记位于节瓜第8号染色体第14520499处碱基，该处碱基发生T到C的突变。在本发明中，精确定位了与节瓜全雌性型紧密连锁的KASP分子标记，并通过该KASP分子标记设计了用于筛选全雌性型节瓜的引物对，利用该引物对，可以在分子层面实现全雌性型和普通性型节瓜材料的精准筛选，提高节瓜雌性育种的效率，具有重要的应用价值。

技术领域

本发明属于分子标记技术领域，更具体地，本发明涉及一种全雌性型节瓜的KASP分子标记、引物及筛选方法。

背景技术

节瓜营养丰富，风味独特，具有清热、解暑、消肿等功效，是重要的功能保健型蔬菜，已成为我国内销和出口的名优特产蔬菜。节瓜富含维生素、氨基酸、微量元素和抗氧化物质，具有清热消暑和止血消炎的功效，是一种药食兼用的多功能蔬菜，已成为华南地区重要的日常消费蔬菜。

节瓜以幼嫩果实为主要食用器官，有连续坐果习性，提高雌花比例有利于实现早熟、高产。全雌性材料具有第一雌花节率低、连续开雌花且数目多、无雄花等特点。在节瓜、丝瓜与苦瓜育种过程中，利用全雌系作为母本配制的杂种一代可以显著提升早熟性，增加单株坐果数和产量。同时，在繁制杂种一代种子时，利用优良全雌系作为母本，雌雄同株的自交系作父本，通过虫媒授粉可以显著提高繁种效率，且可避免人工去雄不彻底，确保杂种一代制种的纯度。因此，全雌性状是影响节瓜产量和杂种一代繁制种的重要性状。

但是，目前我国节瓜优异的全雌性型种质资源较为匮乏，且可以应用到全雌育种中的分子标记较少，极大影响了节瓜全雌育种的效率。广东省农业科学院蔬菜研究所瓜类研究一室在全国率先开展了节瓜雌性系材料创制、强雌性品种的选育以及相关分子遗传研究。2020年研究团队申请的“与节瓜紧密连锁的Indel分子标记gyIndel3及其应用”专利获得了国家知识产权局的授权。但是Indel分子标记仍然需要电泳技术平台，且对于遗传多样性较为匮乏的作物来说，无法获得较多的Indel分子标记，无法精细定位全雌性状。

目前，兴起的KASP(Kompetitive Allele-Specific PCR)利用通用荧光探针，可针对广泛基因组DNA样品，包括复杂基因组DNA样品，对目标SNPs或InDels进行精准的双等位基因分型，较Indel标记具有操作简单，便捷，准确的优点，可以显著提高大规模筛选育种材料的效率。

若是可以筛选到节瓜全雌基因的KSAP分子标记，将对节瓜全雌材料的筛选，具有重要的意义。

发明内容

基于此，本发明的目的之一在于提供一种节瓜全雌性型的KASP分子标记，利用该KASP分子标记，可以检测节瓜材料是全雌性型，还是普通性型。

实现上述发明目的的具体技术方案包括如下：

一种节瓜全雌性型的KASP分子标记，所述KASP分子标记位于节瓜第8号染色体第14520499处碱基，该处碱基发生T到C的突变。

本发明还提供了上述KASP分子标记在制备筛选全雌性型节瓜的试剂盒中的应用。

本发明还提供了上述KSAP分子标记在节瓜辅助选择育种中的应用。

本发明还提供了一种筛选全雌性型节瓜的引物，所述引物包括：序列如SEQ IDNO.1所示的正向引物、以及序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的反向引物。

在其中一些实施例中，所述反向引物的5'端连接有荧光基团FAM或HEX。

在其中一些实施例中，所述序列如SEQ ID NO.2所示的反向引物的5'端连接有荧光基团HEX，所述序列如SEQ ID NO.3所示的反向引物的5'端连接有荧光基团FAM。

本发明还提供了上述筛选全雌性型节瓜的引物在制备筛选全雌性型节瓜的试剂盒中的应用。