[发明专利]一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法在审
| 申请号: | 202210690415.0 | 申请日: | 2022-06-17 |
| 公开(公告)号: | CN115044687A | 公开(公告)日: | 2022-09-13 |
| 发明(设计)人: | 赵家桔;应东山;高玲;张如莲;李莉萍 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院三亚研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6848;C12Q1/6806;C12Q1/04;C12M1/34;C12M1/26;C12M1/12;C12M1/00;C12R1/38 |
| 代理公司: | 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) 11390 | 代理人: | 申龙华 |
| 地址: | 572000 海南省三亚市*** | 国省代码: | 海南;46 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 西瓜 病菌 pcr 检测 方法 | ||
1.一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
第一步,取西瓜汁:通过在西瓜田中随机挑选一些西瓜,通过取汁装置将西瓜去皮与去籽,得到5-10ml的西瓜汁;
第二步,西瓜汁预处理:通过高速离心去掉西瓜汁上清,留沉淀样品,以无菌操作将沉淀样品转入培养基中,室温培养一段时间;
第三步,提取培养后样品中的DNA;
第四步,利用PCR检测技术对上述DNA进行处理,以鉴定上述样品中的西瓜果斑病菌。
2.根据权利要求1所述的一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法,其特征在于,第一步中,挑选西瓜时,选择西瓜刚成熟期进行检测。
3.根据权利要求1所述的一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法,其特征在于,第二步中,培养基为2×YT培养基。
4.根据权利要求1所述的一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法,其特征在于,第二步中,室温培养时间为6-8小时。
5.根据权利要求1所述的一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法,其特征在于,第三步中,提取培养后样品中的DNA具体为:
S1,将2ml的沉淀样品中加入300ul裂解液,30mM三羟甲基氨基甲烷-醋酸,10mM醋酸钠,1mM乙二胺四乙酸,1%十二烷基磺酸钠,pH7.8,混匀,置于37℃水浴1小时;
S2,然后加入100ul5mol/L的氯化钠溶液,混匀后于13000rpm离心15分钟;
S3,取上清液,用苯酚抽提2次,氯仿抽提1次;
S4,加两倍体积无水乙醇,1/10体积醋酸钾3M,pH8.0,-20度保存1小时后,13000rpm离心15分钟,弃上清液,沉淀用70%乙醇洗2次;置于室温干燥后,溶于50ulTE溶液中,置4℃保存备用。
6.根据权利要求1所述的一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法,其特征在于,第三步中,提取培养后样品中的DNA具体为:
S1,将2ml的沉淀样品中加入400ul裂解液,40mM三羟甲基氨基甲烷-醋酸,20mM醋酸钠,1mM乙二胺四乙酸,1%十二烷基磺酸钠,pH7.8,混匀,置于37℃水浴1小时;
S2,然后加入200ul5mol/L的氯化钠溶液,混匀后于13000rpm离心15分钟;
S3,取上清液,用苯酚抽提2次,氯仿抽提1次;
S4,加两倍体积无水乙醇,1/10体积醋酸钾3M,pH8.0,-20度保存1小时后,13000rpm离心15分钟,弃上清液,沉淀用70%乙醇洗2次;置于室温干燥后,溶于50ulTE溶液中,置4℃保存备用。
7.根据权利要求1所述的一种西瓜果斑病菌巢式PCR检测方法,其特征在于,第三步中,提取培养后样品中的DNA具体为:
S1,将2ml的沉淀样品中加入500ul裂解液,50mM三羟甲基氨基甲烷-醋酸,30mM醋酸钠,1mM乙二胺四乙酸,1%十二烷基磺酸钠,pH7.8,混匀,置于37℃水浴1小时;
S2,然后加入300ul5mol/L的氯化钠溶液,混匀后于13000rpm离心15分钟;
S3,取上清液,用苯酚抽提2次,氯仿抽提1次;
S4,加两倍体积无水乙醇,1/10体积醋酸钾3M,pH8.0,-20度保存1小时后,13000rpm离心15分钟,弃上清液,沉淀用70%乙醇洗2次;置于室温干燥后,溶于50ulTE溶液中,置4℃保存备用。
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