[发明专利]一种细胞交叉污染检测方法及其应用有效
申请号: | 202210542989.3 | 申请日: | 2022-05-18 |
公开(公告)号: | CN114717337B | 公开(公告)日: | 2023-10-13 |
发明(设计)人: | 伍义行;张彤彤;朱羽婕;廉润通;叶子弘;俞晓平;马爱进;赵同标 | 申请(专利权)人: | 中国计量大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C40B50/06;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州五洲普华专利代理事务所(特殊普通合伙) 33260 | 代理人: | 姚宇吉 |
地址: | 310000 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细胞 交叉 污染 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种细胞交叉污染检测方法,其特征在于包括如下步骤:
S1:制备细胞交叉污染样本,并进行细胞DNA提取;
S2:根据位点信息设计引物建立多重PCR扩增体系;
S3:文库构建成功后进行高通量测序分析;
S4:按照判定标准,确认细胞是否存在交叉污染。
2.根据权利要求1所述的一种细胞交叉污染检测方法,其特征在于:步骤S2中,在131个微单倍型位点上拆分成172个扩增片段,每个扩增片段均包括一个正向引物和一个反向引物,正向引物和反向引物的序列为SEQ ID No.1-SEQ ID No.344。
3.根据权利要求2所述的一种细胞交叉污染检测方法,其特征在于:步骤S2中,共进行两轮PCR反应,第1轮多重PCR反应分为2个反应管进行,第1轮PCR扩增后,将2个反应管的PCR产物合并,经磁珠纯化后,进行第2轮多重PCR反应;取第2轮多重PCR反应产物磁珠纯化后,吸取上清液,并将其转移到新的PCR管中,即为制备的多重PCR文库。
4.根据权利要求1所述的一种细胞交叉污染检测方法,其特征在于:已知单一细胞样本测序分型结果,步骤S4的结果判定标准如下:与单一细胞样本分型结果比较,若检测到单一细胞样本不存在的基因型,即可判断培养细胞存在细胞交叉污染。
5.根据权利要求1所述的一种细胞交叉污染检测方法,其特征在于:未知单一细胞样本测序分型结果,步骤S4的结果判定标准如下:至少两个基因座出现三个及三个以上等位基因时,或者该检测体系中两个以上扩增片段出现多于3个基因型,即可判断培养细胞存在细胞交叉污染。
6.权利要求1-5所述的任意一种细胞交叉污染检测方法,在细胞制剂的质量控制中的应用。
7.权利要求1-5所述的任意一种细胞交叉污染检测方法,在细胞库对储存细胞系质量的监测中的应用。
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