[发明专利]MMP2基因多态性作为猪产仔数性状的遗传标记及应用

权利要求书

1.一种与猪产仔数性状相关的SNP遗传标记，所述猪品种为大白猪，所述性状为活产仔数和死胎数性状，所述SNP遗传标记的核苷酸序列如下所示：

TGGTCCCTTCCCACAACAAGCCCACCTCTCATGCCAGGGTCTGGAATGGTCAGCCTGCTCTACAGAGGAGGCTCTGGGAGTCTTCCCTCAAAGCAGCAGAACTGAGGAAGTTCCCATTGTGGCCCAGTGGAAACGAATCTAACTAGTATCCATGAAGATGCATGTTCGATCCCCAGCCTTGTTCAGTGGGTCAAGGATCCGGCATTGCCATGAGCTATGGTGGAGGTCACAGATGCAGCTCCGATTCTGCGTTGCTGTGGCTGTGATGTAGGCTGGCAGCTGCAGCTCCGATTTGATTCCTAGCCTGGGATCTTCCATATGCCACAAGTGTGGCCCTAAAATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGCAAAACGGAAACATCTATTGAAGGCTCTGGGTGGGTTTCCAGAGGAGACRGATCTTTTTCCCAGGGGAGGTGGTGAATGAGCTGAAGCCATTGGTCCCACTGTAGAGTCGGCAAAGGCCCGGGCCTCCTTGCTGGAGAAGGAAAGCCCCAGAACAATGCAGGATAAGCAGCTGCTTCCAGCAAAAGCAACCCCTAGCTCATGCCAGGATGTGCTTAGCCTTTGCTTCTGGAAGCTTCCATTAAGCCCACAAAAATACATGCAATACCTCTTGTGTGCCAGGCACTTATCTAGGTGCTGCAAGACAATGGTAAAAACACAGTCACTCTCAAGAGTTTCCACTGTGTCACACTGGATTAAGAATCTGACTGCAGCAGCAAGGGTCGCTATGGAGGTGCAGGTTCAATCCCTAGCCCAGCGCAGTGAGTTCAGGGATTCACCTTTGCTGTATCGGCAGTGTAGGTTG，

上述序列中第425碱基位的R是A或T，该突变引起BgIII酶切位点多态性。

2.一种检测猪MMP2基因分型的标记引物，所述猪品种为大白猪，所述性状为活产仔数和死胎数性状，其特征在于，所述引物的DNA序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示；其中：

TT基因型的头胎产活仔数显著高于TA基因型；AA基因型的经产死胎数显著高于TA基因型；AA基因型的总胎次死胎数极显著高于TA基因型；AA基因型的总胎次产活仔数显著高于TA基因型，TA基因型是减少死胎数有益基因型。

3.一种筛选与猪产仔数性状相关的SNP遗传标记的方法，其特征在于，所述猪品种为大白猪，所述筛选方法包括如下步骤：

从大白猪血液或毛发中提取基因组DNA，登录Ensembl数据库下载MMP2基因序列，从测序结果中寻找SNP位点，确定该SNP位点的内切酶，设计如SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4所示的特异引物；以大白猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，利用单核苷酸多态性检测，对基因型与产仔数性状间进行相关性分析。