[发明专利]对虾繁殖性状相关的分子标记9W1及其应用

说明书

本发明提供了对虾繁殖力性状相关的分子标记9W1及其应用。所述分子标记9W1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，其中第301位碱基A在凡纳滨对虾高繁殖力群体中的等位基因频率≥80.00%。本发明还提供了所述的分子标记9W1的引物，包括核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的扩增引物以及核苷酸序列如SEQ ID No.4所示的延伸引物。凡纳滨对虾高繁殖力分子标记9W1可以不受生长阶段的限制，能够用于凡纳滨对虾早期选育，快速选育出繁殖性状优良的亲本群体，促进凡纳滨对虾高繁殖力新品种的选育进程。

技术领域

本发明属于水产动物分子标记辅助育种领域，具体涉及对虾繁殖性状相关的分子标记9W1及其应用。

背景技术

凡纳滨对虾(Penaeus vannamei)又称南美白对虾、太平洋白虾，隶属于节肢动物门(Arthropoda)、甲壳纲(Crustaeea)、十足目(Deeapoda)、对虾科(Penaeidae)、对虾属(Penaeus)，是我国和世界养殖产量最高的对虾种类，也是单一产值最高的水产养殖种类之一。2020年我国养殖产量超过180万吨，产值超过700亿元，约占世界总产量的40％。我国每年种虾需求量超过100万对，苗种需求量超过1.5万亿尾。凡纳滨对虾具有产卵量高，可多次产卵的特性。然而在苗种生产中，雌虾的繁殖能力存在巨大个体差异。在一个生产周期中，部分雌虾从未产卵，而有的雌虾能够多次产卵。培育高繁殖力(产卵和产卵量)新品种，对于提高育苗效率，节省生产成本具有重要意义。繁殖性状属中低遗传力性状，传统的育种方法进展缓慢，借助分子标记辅助育种技术可有效加快选育进程。

作为第三代分子标记，单核苷酸多态性标记(SNP)具有丰富度高、密度大、稳定性强、共显性等特点，成为目前虾、蟹等经济甲壳动物中应用最广泛的分子标记技术。目前，有关凡纳滨对虾繁殖相关SNP标记的开发较少，并且产业中缺乏可应用于分子标记辅助育种的标记。因此，开发高繁殖力的分子标记对凡纳滨对虾的新品种培育具有重要意义。

发明内容

本发明提供了对虾繁殖性状相关的分子标记9W1及其应用。分子标记9W1能够用于凡纳滨对虾高繁殖力品群体的筛选中，其鉴定效率及准确率高。

为实现上述发明目的，本发明采用以下技术方案予以实现：

本发明提供了对虾繁殖性状相关的分子标记9W1，所述分子标记9W1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。

进一步的，所述分子标记9W1的第301位碱基A为候选9W1_SNP位点。

进一步的，所述碱基A在凡纳滨对虾高繁殖力群体中的等位基因频率≥80.00％。

本发明还提供了所述的分子标记9W1的引物，所述引物包括核苷酸序列如SEQ IDNo.2和SEQ ID No.3所示的扩增引物以及核苷酸序列如SEQ ID No.4所示的延伸引物。

本发明还提供了所述的分子标记9W1或者所述的分子标记9W1的引物在用于筛选具有高繁殖力的凡纳滨对虾群体中的应用。

进一步的，筛选具有高繁殖力的凡纳滨对虾群体的具体步骤为：提取凡纳滨对虾群体内(家系、品系或地理群体)测试样品的DNA，并将其作为模板，利用所述引物进行飞行质谱分型，若分型结果中分子标记的第301位碱基A的等位基因频率≥80.00％，则选择该凡纳滨对虾群体作为培育凡纳滨对虾高繁殖力的亲本。

进一步的，所述凡纳滨对虾家系或群体测试样品的数量在30尾以上。

进一步的，在飞行质谱分型中，PCR扩增的条件为预变性94℃3min；变性94℃30s，退火56℃25s，延伸72℃30s，共重复40个循环；最后延伸72℃4min；4℃保存。