[发明专利]水稻wx基因的检测引物、检测试剂盒及其应用在审
申请号: | 202210443780.1 | 申请日: | 2022-04-26 |
公开(公告)号: | CN115491429A | 公开(公告)日: | 2022-12-20 |
发明(设计)人: | 倪大虎;周燃;宋丰顺;甘泉;林翠香 | 申请(专利权)人: | 安徽省农业科学院水稻研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京思元知识产权代理事务所(普通合伙) 11598 | 代理人: | 余光军;霍雪梅 |
地址: | 230031 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻 wx 基因 检测 引物 试剂盒 及其 应用 | ||
1.水稻wx基因的检测引物,其特征在于,选自引物对(1)或引物对(2)中的任何一对,其中,所述引物对(1)由核苷酸序列为SEQ ID No.1所示的引物和核苷酸序列为SEQ ID No.2所示的引物组成;所述引物对(2)由核苷酸序列为SEQ ID No.3所示的引物和核苷酸序列为SEQ ID No.4所示的引物组成。
2.一种水稻wx基因PCR检测试剂盒,包括:Taq酶、dNTP、Mg2+、去离子水和检测引物;其特征在于,所述的检测引物选自引物对(1)或引物对(2)中的任何一对,所述引物对(1)由核苷酸序列为SEQ ID No.1所示的引物和核苷酸序列为SEQ ID No.2所示的引物组成;所述引物对(2)由核苷酸序列为SEQ ID No.3所示的引物和核苷酸序列为SEQ ID No.4所示的引物组成。
3.权利要求1所述的检测引物在判定水稻样品中是否存在wx基因或者wx基因的纯合体和杂合体中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,包括:
(1)提取待检测水稻样品的DNA;
(2)以提取的DNA为模板,以权利要求1所述的引物对(1)或引物对(2)为PCR扩增引物建立PCR扩增体系进行PCR扩增;
(3)利用引物(1)扩增,如果扩增结果只有140bp条带,则待检测的水稻样品为含有wx基因纯合体;如果扩增结果只有117bp条带,则待检测的水稻样品不含有wx基因;如果扩增结果同时含有140bp和117bp两条条带,则待检测的水稻样品为含有wx基因的杂合株;
利用引物对(2)扩增,如果扩增结果只有199bp条带,则待检测的水稻样品为含有wx基因纯合体;如果扩增结果只有176bp条带,则待检测的水稻样品不含有wx基因;如果扩增结果同时含有199bp和176bp两条带,则待检测的水稻样品为含有wx基因的杂合株。
5.权利要求1所述的检测引物在水稻wx基因辅助选育中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,包括:
(1)用优良水稻品系与含有wx基因的糯稻材料杂交并回交,利用权利要求1所述的引物对(1)或引物对(2)扩增各杂交或回交世代单株wx基因位点,并对扩增的PCR产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;
(2)利用引物(1)扩增,如果扩增结果含有140bp条带,则可判断样品中存在wx基因,利用引物(2)扩增,如果扩增结果含有199bp条带,则可判断样品中存在wx基因,辅助选育含有糯性基因且农艺性状优良的单株。
7.权利要求1所述的检测引物在判断水稻自交分离群体单株是否为wx基因纯合体中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,包括:
(1)提取待检测的自交分离群体单株的DNA;
(2)以提取的DNA为模板,以引物对(1)或引物对(2)为PCR扩增引物建立PCR扩增体系进行PCR扩增;
(3)利用引物对(1)扩增,如果扩增结果只有140bp条带,则检测样品单株为携带wx基因纯合单株,如果扩增结果同时含有140bp和117bp两条条带,则检测样品单株为携带wx基因的杂合株;利用引物对(2)wx-2扩增,如果扩增结果只有199bp条带,则检测样品单株为携带wx基因纯合单株,如果扩增结果同时含有199bp和176bp两条带,则检测样品单株为携带wx基因的杂合株。
9.权利要求1所述的检测引物在糯稻品种纯度鉴定中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,于,包括:
(1)提取待检测的糯稻品种的DNA;
(2)以提取的DNA为模板,以权利要求1所述的引物对(1)或引物对(2)为PCR扩增引物建立PCR扩增体系进行PCR扩增;
(3)利用引物对(1)扩增,如果电泳结果只有140bp条带的为携带纯合wx基因的糯稻单株,同时含有140bp和117bp两条条带的为携带杂合wx基因的糯稻单株,只含有117bp条带的为非糯稻单株混杂;
利用引物对(2)扩增,如果电泳结果只有199bp条带的为携带纯合wx基因的糯稻单株,含有199bp和176bp两条条带的单株为携带杂合wx基因的糯稻单株,只含有176bp条带的为非糯稻单株混杂;
(4)按以下公式计算水稻样品纯度:
式中:
P—样品纯度;
NT—为供检种子粒数(幼苗数、株数);
ND—为判定为混杂株的种子粒数(幼苗数、株数)。
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