[发明专利]DGAT1基因启动子区域变异位点及其在检测猪肉肌内脂肪含量上的应用在审
申请号: | 202210342626.5 | 申请日: | 2022-04-02 |
公开(公告)号: | CN114854868A | 公开(公告)日: | 2022-08-05 |
发明(设计)人: | 陈杰;赵金迪;韦伟;张立凡 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 徐冬涛;李晓峰 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dgat1 基因 启动子 区域 变异 及其 检测 猪肉 脂肪 含量 应用 | ||
1.一种用于检测猪肌内脂肪含量的SNP分子标记,其特征在于:该SNP分子标记位于DGAT1基因启动子区的转录起始密码子上游379bp处,该位点碱基是C或T。
2.权利要求1所述的SNP分子标记在检测猪肉肌内脂肪含量中的应用,其特征在于:当所述SNP分子标记的基因型为TT型或CT型时,猪肉肌内脂肪含量高于CC型基因型。
3.一种用于检测权利要求1所述SNP分子标记的引物对,其特征在于:所述引物对的序列分别为:
DGAT1-3F:5’-CCACAACGCACTAGGCATTTC-3’
DGAT1-3R:5’-GGGCACCACTACCTCAGATCC-3’。
4.一种用于对权利要求1所述SNP分子标记的C/T突变位点进行基因分型的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含权利要求3所述的引物对。
5.权利要求3中所述的引物对,或权利要求4中所述的试剂盒在检测猪肉肌内脂肪含量中的应用,其特征在于:对所述SNP分子标记的C/T突变位点进行基因分型,基因型为TT或CT的猪肉样品的肌内脂肪含量高于基因型为CC的猪肉样品的肌内脂肪含量。
6.一种辅助选育猪高肌内脂肪性状遗传改良的方法,其特征在于:对权利要求1所述SNP分子标记的C/T突变位点进行基因分型,基因型为TT或CT的猪肉样品的肌内脂肪含量高于基因型为CC的猪肉样品的肌内脂肪含量。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:
1)提取待检测猪肉样品的DNA;
2)采用权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒对步骤1)获得的DNA进行PCR扩增,获得扩增片段;
3)通过PCR-RFLP-PvuⅡ方法对扩增片段进行酶切分型,不同基因型的酶切产物会呈现不同的条带数:CC基因型为134bp和581bp两个条带,CT基因型为134bp、581bp和715bp三个条带,TT基因型为715bp一个条带;
4)当分型结果为TT型或CT型时,判断其猪肉样品的肌内脂肪含量高于CC型的猪肉样品肌内脂肪含量。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:步骤2)中PCR扩增反应25μl体系:T3 mix22μl、上下游引物各1μl、待检测DNA 1μl;PCR反应程序:98℃,3min;98℃,10s;65℃,10s退火;72℃,10s;34个循环;72℃,3min。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述PCR-RFLP-PvuⅡ方法的反应体系为:待检测PCR扩增产物17μl、PvuⅡ酶1μl、Tango Buffer 2μl;反应条件为:37℃,1h。
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