[发明专利]大口黑鲈食性驯化相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了大口黑鲈食性驯化相关的SNP标记及其应用，所述SNP标记如SEQ IDNO.1所示，其中第448位R为碱基A或碱基G。并提供了检测该SNP标记的引物、试剂盒和检测方法；该分子标记可作为大口黑鲈驯食性状的可靠标记，便于进行早期选择，从而提高选择驯食成功率，提高选育效率和准确性，用于快速筛选易驯食大口黑鲈，为培育大口黑鲈易驯食人工配合饲料新品种提供理论依据。

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，具体涉及大口黑鲈驯食性状相关的SNP标记及其应用。

背景技术

大口黑鲈(Micropterus salmoides)属于凶猛肉食性鱼类，原产于北美洲，具有无肌间刺、肉质鲜美、生长迅速、养殖周期短等优点。经养殖推广，现已成为我国重要的淡水养殖经济鱼类。据渔业统计年鉴显示，2020年我国大口黑鲈养殖总产量为61.95万吨。作为一种肉食性鱼类，大口黑鲈传统养殖投喂方式以海洋捕捞的低质杂鱼为主，但这种生产方式不仅给我国海洋渔业资源带来巨大的压力，同时也存在劳动强度大、季节性冰鲜鱼供应不足、转化效率低、环境污染严重、病害和用药增多等诸多问题。随着大口黑鲈易摄食配合饲料新品种“优鲈3号”的培育以及配合饲料的逐渐成熟，大口黑鲈目前可全程摄食配合饲料。但在早期驯食(由桡足类等生物饵料向人工配合饲料的驯化)配合饲料过程中，部分个体拒食配合饲料，导致驯化成功率低。如何提高大口黑鲈驯食过程中的成功率是当前产业亟待解决的关键问题。

随着分子生物技术的快速发展，分子标记辅助育种技术有望是提高大口黑鲈驯食成功率和培育大口黑鲈优良品质的一种重要途径。分子标记辅助育种技术是通过与目的基因紧密连锁或共分离的分子标记，对目的基因进行筛选，从而不受环境条件的影响，增加了选择的可靠性，提高育种效率。单核苷酸多态性标记(Single nucleotide polymorphism,SNP)指的是在基因组水平上单个核苷酸发生改变而引起的DNA序列多态性，具有数量多、密度大、遗传稳定性高等优点而被广泛应用。将这些遗传标记与驯食性状相关联，从而实现在DNA水平上进行选择育种，有效的避免人为影响并提高选择育种的准确性，并且可实现在早期鉴定出具有优良性状的个体，筛选出优良的后备亲本，提高驯食成功率。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与大口黑鲈驯食性状相关的SNP标记及其应用，该分子标记可作为大口黑鲈驯食性状的可靠标记，便于进行早期选择，从而提高选择驯食成功率，提高选育效率和准确性。

本发明所采取的技术方案是：

本发明的第一方面，提供与大口黑鲈食性驯化相关的SNP标记，所述SNP标记如SEQID NO.1所示，其中第448位R为碱基A或碱基G。

本发明的第二方面，提供本发明第一方面所述的SNP标记在鉴定或筛选易驯食的大口黑鲈中的应用。

本发明的第三方面，提供一种引物，所述引物用于检测本发明第一方面所述的SNP标记。

在本发明的一些实施方式中，所述引物包括SEQ ID NO.2序列和SEQ ID NO.3序列。

本发明的第四方面，提供一种试剂盒，所述试剂盒包含检测本发明第一方面所述的SNP标记的试剂。

在本发明的一些实施方式中，所述试剂盒包含本发明第三方面所述的引物。

本发明的第四方面，提供本发明第三方面所述引物或本发明第四方面所述试剂盒在鉴定或筛选易驯食的大口黑鲈中的应用。

本发明的第五方面，提供一种鉴定或筛选易驯食的大口黑鲈的方法，检测本发明第一方面所述的SNP标记，选择SEQ ID NO.1序列的第448位的SNP位点基因型为AA基因型的大口黑鲈作为易驯食的大口黑鲈。