[发明专利]微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组、探针及应用在审
申请号: | 202210313315.6 | 申请日: | 2022-03-28 |
公开(公告)号: | CN114622038A | 公开(公告)日: | 2022-06-14 |
发明(设计)人: | 谢芝勋;张艳芳;曾婷婷;张民秀;谢丽基;罗思思;黄娇玲;王盛;邓显文;谢志勤;刘加波 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12N15/11;C12Q1/686 |
代理公司: | 北京卓岚智财知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11624 | 代理人: | 魏伟 |
地址: | 530001 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 微滴式 数字 pcr 检测 圆环 病毒 引物 探针 应用 | ||
1.微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针,其特征在于:所述引物组和探针的核苷酸序列如下所示:
上游引物AGV2-F:5’GACGATGGAGGAGTCACTGGTT 3’(SEQ ID NO:1);
下游引物AGV2-R:5’GTCCGTCTGGGTYTCCTGTGT 3’(SEQ ID NO:2);
探针AGV2-P:5’FAM-CAGGAGGCTAGTGGACT-BHQ1 3’(SEQ ID NO:3)。
2.根据权利要求1所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针,其特征在于:所述上游引物AGV2-F、下游引物AGV2-R和探针AGV2-P的摩尔比为9:9:5。
3.根据权利要求1所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:退火温度为54.0℃。
4.微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:总的扩增体系为20μL:dd PCRTMSupermix for Probe 10μL,设置6个不同引物探针组合,浓度为600、600、900、900、1200、1200nmol/L上下游引物各1μL,对应浓度梯度为150、300、250、500、350、600nmol/L的探针1μL,模板2μL,最后用ddH2O补足20μL反应体系。
5.根据权利要求4所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:dd PCR反应程序为:95℃预变性10min;94℃30s,退火温度60.0~50.0℃,40个循环,98℃固化10min,4℃结束反应,升降温度设置2.0℃/s。
6.根据权利要求5所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:Real-time PCR反应体系为20μL:Probe qPCR Mix,with UNG 10μL,上下游引物各0.4μL,浓度为900nmol/L,探针0.8μL,浓度为900nmol/L,ROX ReferenceDye 0.4μL,模板2μL,ddH2O 6μL。
7.根据权利要求6所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:反应程序:95℃预变性30s;95℃5s,退火温度60℃34s,40个循环;4℃结束反应。
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