[发明专利]一种无核酸扩增可视化的RNA定量检测方法有效

专利信息
申请号: 202210239301.4 申请日: 2022-03-11
公开(公告)号: CN114807316B 公开(公告)日: 2023-02-03
发明(设计)人: 王辉;李正平;王洪红 申请(专利权)人: 北京科技大学
主分类号: C12Q1/6825 分类号: C12Q1/6825;C12Q1/70;C12R1/93
代理公司: 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 代理人: 岳野
地址: 100083*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 核酸 扩增 可视化 rna 定量 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种无核酸扩增可视化的RNA定量检测方法,所述RNA定量检测方法用于非疾病诊断治疗方法,其特征在于,所述RNA定量检测方法包括:

S1:设计制备CRISPR-Cas13系统响应的RNA交联DNA水凝胶;

S2:将S1制备的DNA水凝胶固定在毛细管末端形成DNA水凝胶薄膜,由DNA水凝胶薄膜与毛细管共同组成自驱动DNA水凝胶传感器;

S3:设计合成靶标RNA特异性的crRNA;

S4:将crRNA、Cas13蛋白和已知浓度靶标RNA在缓冲溶液中共同孵育后,获得含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液;

S5:将自驱动DNA水凝胶传感器水平浸入含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液;

S6:通过S5中溶液在毛细管中的移动距离,构建靶标RNA分子浓度与移动距离之间的线性对应关系;

S7:将crRNA、Cas13蛋白和未知浓度靶标RNA在缓冲溶液中共同孵育后,获得未知浓度的含有靶标RNA分子的待测样品溶液,将自驱动DNA水凝胶传感器水平浸入含有靶标RNA分子的待测样品溶液,根据S6中线性对应关系对待测样品中靶标RNA分子进行可视化检测及定量分析;

所述S1具体包括:

S11:设计合成两条acrydite修饰的DNA链,A-DNA-X和A-DNA-Y;

S12:设计合成双重功能的交联单链RNA,DRCL-ssRNA;

S13:将A-DNA-X和A-DNA-Y分别与丙烯酰胺单体共聚,分别形成两条直链聚丙烯酰胺-DNA,PA-X和PA-Y;

S14:DRCL-ssRNA包含三个序列区域,其中,3'-和5'-末端的两个序列分别与DNA-X和DNA-Y互补配对,在室温下形成具有三维多孔结构的DNA水凝胶;

所述S14中DNA水凝胶的中间序列为CRISPR-Cas13系统响应序列,即CRISPR-Cas13系统反式切割反应的底物序列;

所述S6中毛细管中的移动距离具体为:靶标RNA分子激活CRISPR/Cas13系统的附属酶切活性,使毛细管末端的DNA水凝胶薄膜的通透性增加,靶标RNA分子的浓度越大,溶液在毛细管中移动距离越大,且靶标RNA分子浓度与溶液在毛细管中移动距离成线性关系。

2.根据权利要求1所述的RNA定量检测方法,其特征在于,所述S5具体为:将S4中所制备的自驱动DNA水凝胶传感器水平浸入含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液,在毛细作用下,含有靶标RNA分子的溶液通过DNA水凝胶薄膜进入毛细管。

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