[发明专利]一种无核酸扩增可视化的RNA定量检测方法有效
申请号: | 202210239301.4 | 申请日: | 2022-03-11 |
公开(公告)号: | CN114807316B | 公开(公告)日: | 2023-02-03 |
发明(设计)人: | 王辉;李正平;王洪红 | 申请(专利权)人: | 北京科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6825 | 分类号: | C12Q1/6825;C12Q1/70;C12R1/93 |
代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 岳野 |
地址: | 100083*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 核酸 扩增 可视化 rna 定量 检测 方法 | ||
1.一种无核酸扩增可视化的RNA定量检测方法,所述RNA定量检测方法用于非疾病诊断治疗方法,其特征在于,所述RNA定量检测方法包括:
S1:设计制备CRISPR-Cas13系统响应的RNA交联DNA水凝胶;
S2:将S1制备的DNA水凝胶固定在毛细管末端形成DNA水凝胶薄膜,由DNA水凝胶薄膜与毛细管共同组成自驱动DNA水凝胶传感器;
S3:设计合成靶标RNA特异性的crRNA;
S4:将crRNA、Cas13蛋白和已知浓度靶标RNA在缓冲溶液中共同孵育后,获得含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液;
S5:将自驱动DNA水凝胶传感器水平浸入含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液;
S6:通过S5中溶液在毛细管中的移动距离,构建靶标RNA分子浓度与移动距离之间的线性对应关系;
S7:将crRNA、Cas13蛋白和未知浓度靶标RNA在缓冲溶液中共同孵育后,获得未知浓度的含有靶标RNA分子的待测样品溶液,将自驱动DNA水凝胶传感器水平浸入含有靶标RNA分子的待测样品溶液,根据S6中线性对应关系对待测样品中靶标RNA分子进行可视化检测及定量分析;
所述S1具体包括:
S11:设计合成两条acrydite修饰的DNA链,A-DNA-X和A-DNA-Y;
S12:设计合成双重功能的交联单链RNA,DRCL-ssRNA;
S13:将A-DNA-X和A-DNA-Y分别与丙烯酰胺单体共聚,分别形成两条直链聚丙烯酰胺-DNA,PA-X和PA-Y;
S14:DRCL-ssRNA包含三个序列区域,其中,3'-和5'-末端的两个序列分别与DNA-X和DNA-Y互补配对,在室温下形成具有三维多孔结构的DNA水凝胶;
所述S14中DNA水凝胶的中间序列为CRISPR-Cas13系统响应序列,即CRISPR-Cas13系统反式切割反应的底物序列;
所述S6中毛细管中的移动距离具体为:靶标RNA分子激活CRISPR/Cas13系统的附属酶切活性,使毛细管末端的DNA水凝胶薄膜的通透性增加,靶标RNA分子的浓度越大,溶液在毛细管中移动距离越大,且靶标RNA分子浓度与溶液在毛细管中移动距离成线性关系。
2.根据权利要求1所述的RNA定量检测方法,其特征在于,所述S5具体为:将S4中所制备的自驱动DNA水凝胶传感器水平浸入含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液,在毛细作用下,含有靶标RNA分子的溶液通过DNA水凝胶薄膜进入毛细管。
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