[发明专利]SNPs分子标记g.43756 G>A及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用有效
申请号: | 202210236801.2 | 申请日: | 2022-03-11 |
公开(公告)号: | CN114381531B | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 单慧丽;姜俊芳;蒋永清;吴建良;曹阳 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州恒翌专利代理事务所(特殊普通合伙) 33298 | 代理人: | 柯奇君 |
地址: | 310022 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | snps 分子 标记 43756 及其 湖羊 辅助 育种 中的 应用 | ||
本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域,具体涉及一种湖羊体长性状相关SNPs分子标记g.43756 G>A、引物对、试剂盒及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。其中,AA型个体的体长显著高于GA型个体,GG型个体与GA,AA型个体相比差异不显著。通过本发明提供的分子标记及其引物对和试剂盒,采用相关检测方法,能够筛选出湖羊的体长性状,起到辅助育种作用。
技术领域
本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域,具体涉及一种湖羊体长性状相关SNPs分子标记g.43756G>A、引物对、试剂盒及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。
背景技术
湖羊是我国著名的一个绵羊品种,以繁殖力强、早期生长速度快、适应舍饲及高湿高热环境等特点而出名。但湖羊产在肉性能方面与杜泊羊、德国美利奴羊等国外肉用绵羊品种还存在较大差异。因此,非常有必要对湖羊生长性能进行选育,提高湖羊的产肉性能。
本申请人已有授权中国发明专利(公开号:CN109251986A、CN109182553A、CN109251987A、CN109251985A、CN109182554A和CN109055579A)公开了利用GWAS技术筛选的湖羊体尺性状候选功能基因及SNPs,并通过SNPs的群体验证,获得了可用于分子标记辅助育种的SNPs,可用于湖羊肉用性状分子标记辅助育种和湖羊肉用系核心群个体的早期选育。
ARHGAP24基因是Rho GTP酶激活蛋白家族的成员,可作为Rho GTP酶的负调节剂,并影响肌动蛋白重塑、细胞极性、细胞迁移、分化和发育。ARHGAP24(也称为p73-RHOGAP或FilGAP)位于细胞质和细胞连接处,在血管生成过程中发挥重要的调节作用。
目前发现ARHGAP24基因参与肾脏中癌细胞的增殖、细胞周期、凋亡、迁移和侵袭,在该癌细胞中作用是由活化的ARF6诱导的乳腺癌细胞造成伪足形成,并且通过增加Rac1活性促进胶质母细胞瘤的肿瘤生长。肺腺癌中出现ARHGAP24表达下调,将会出现癌细胞的紫杉醇耐药表型。
在哺乳动物中Rho GTP家族与多种细胞功能有关,包括肌动蛋白细胞骨架的重组,细胞生长控制,转录调控和膜运输,在动物生长发育过程中还与肺发育,呼吸系统发育,血管形态发生,心脏发育和转录调控有关。在关于杜洛克猪的生产性状的GWAS分析中已经发现ARHGAP24与生产性状显著相关。结合此前的研究,ARHGAP24中的突变可能与细胞生长调控中的某些功能有关,从而从一些未知的通路调控进一步影响了湖羊的生长特性。
发明内容
为了解决分子标记育种中现有技术的欠缺和现实需要求,本发明的目的是提供一种与湖羊体长性状显著相关的SNPs分子标记及其检测引物对和试剂盒,并提供所述分子标记的筛选方法和在湖羊分子标记育种中的应用。
为了实现上述的发明目的,本申请采用了以下的技术方案:
一种与湖羊体长性状显著相关的SNPs分子标记,该分子标记定位为g.43756G>A。
进一步,本申请提供了一种用于检测所述SNPs分子标记的引物对。
进一步,本申请提供了所述的引物对扩增获得的扩增产物,该扩增产物的序列如SEQ ID NO:1所示。
进一步,本申请提供了一种用于扩增所述的扩增产物的引物对。
作为优选,所述引物对的序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。
进一步,本申请提供了一种包含所述引物对的试剂盒。
进一步,本申请提供了所述的SNPs分子标记、引物对和试剂盒在筛选湖羊体长性状和湖羊分子标记育种中的应用;其中,AA型个体的体长显著高于GA型个体,GG型个体与GA,AA型个体相比差异不显著。
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