[发明专利]一种利用16srDNA测序技术检测肠道菌群辅助分析支气管哮喘的方法在审
| 申请号: | 202210143451.5 | 申请日: | 2022-02-16 |
| 公开(公告)号: | CN114717340A | 公开(公告)日: | 2022-07-08 |
| 发明(设计)人: | 胡霞芬;王强 | 申请(专利权)人: | 武汉科技大学 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6869;C12R1/01 |
| 代理公司: | 武汉大楚知识产权代理事务所(普通合伙) 42257 | 代理人: | 徐杨松;高源 |
| 地址: | 430080 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 利用 16 srdna 技术 检测 肠道 辅助 分析 支气管哮喘 方法 | ||
本发明公开了一种利用16SrDNA测序技术检测肠道菌群辅助分析支气管哮喘的方法,包括如下步骤:S1.取多个健康人的粪便组织,对粪便组织细菌进行定量检测、测序,分门统计拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和脱铁杆菌门的占比数据;S2.取患者的粪便组织,对粪便组织细菌进行定量检测、测序,分门统计拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和脱铁杆菌门的占比数据;S3.将步骤S2获得的患者数据与步骤S1获得的健康人群数据进行对比,得出检测结果。本发明采用16SrDNA测序技术,检测肠道菌群,将检测结果与正常健康患者的肠道菌群检测结果对比,辅助判断哮喘病和哮喘类型,准确率较高,具有极大的辅助诊断参考价值。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种利用16SrDNA测序技术检测肠道菌群辅助分析支气管哮喘的方法。
背景技术
哮喘这一疾病以持续性慢性气道炎症为主要特征,使气道呈高反应状态,接触诱因时更容易反复发生哮喘症状。根据2018年的Global Initiative for Asthma(GINA)统计数据,全球哮喘的流行性在不同国家约占各国人口总数的1%-16%。全球疾病负担研究组织指出,哮喘疾病每年导致约1380万生命的伤残,约占全球疾病负担的1.8%。哮喘疾病导致全球每年34万6千例死亡。
哮喘分为支气管哮喘、激素依赖型或者激素抵抗型哮喘、妊娠哮喘和运动性哮喘等几种类型。而哮喘的症状与心源性哮喘、喘息型慢性支气管炎和支气管肺癌等疾病的症状极为类似,均表现出反复发作的喘息,气促、胸闷和咳嗽等症状。不同类型的疾病,治疗方式有极大的区别,不同类型的哮喘病,采用的治疗方案也有很大差异。因此,准确诊断哮喘疾病,判断哮喘疾病类型是治疗哮喘病的关键。目前临床上对于哮喘的诊断主要以医生经验判断,或者试探性治疗判断,亦或者进行支气管舒张实验、支气管激发试验判断等方式诊断。但是上述诊断方式难以精确判断哮喘病和哮喘类型。
发明内容
本发明针对现有技术中存在的不足,提供一种利用16SrDNA测序技术检测肠道菌群辅助分析支气管哮喘的方法,采用16SrDNA测序技术,检测肠道菌群,将检测结果与正常健康患者的肠道菌群检测结果对比,辅助判断哮喘病和哮喘类型,准确率较高,具有极大的辅助诊断参考价值。
为解决上述问题,本发明的技术方案如下:本发明保护一种利用16SrDNA测序技术检测肠道菌群辅助分析支气管哮喘的方法,包括如下步骤:
S1.制备健康人群肠道菌群数据:取多个健康人的粪便组织,对粪便组织细菌16SrRNA的V3-V4区域PCR扩增,并对扩增产物进行定量检测、测序,分门统计拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和脱铁杆菌门的占比数据;
S2.检测患者肠道菌群数据:取患者的粪便组织,对粪便组织细菌进行16SrRNA的V3-V4区域PCR扩增,并对扩增产物进行定量检测、测序,分门统计拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和脱铁杆菌门的占比数据;
S3.对比判断:将步骤S2获得的患者数据与步骤S1获得的健康人群数据进行对比,分别比对四类细菌群落占比差异,判断患者的拟杆菌门和脱铁杆菌门占比是否增加,厚壁菌门和变形菌门占比是否降低,如果符合则患者较大概率患有支气管哮喘,不符合则患者患有支气管哮喘的概率较低。
在上述技术方案的基础上,本发明还有如下改进。
进一步,所述步骤S1和S2中,取粪便组织,对粪便组织细菌16SrRNA的V3-V4区域PCR扩增的具体步骤为:首先,提取粪便组织的基因组总DNA;然后,使用1%琼脂糖凝胶电泳和超微量分光光度计检测抽提基因组DNA;最后,对细菌16SrRNA的V3-V4区域进行PCR扩增。
优选的,所述PCR扩增的具体步骤为:在4μL 5×FastPfu缓冲液,2μL 2.5mMdNTPs,0.8μL 5μM正向引物,0.8μL 5μM反向引物,0.4μL FastPfu聚合酶,10ng模板DNA,0.2μL牛血清蛋白,补ddH2O至20μL中行PCR扩增,所述正向引物采用338F,所述反向引物采用806R。
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