[发明专利]与花生抗青枯病主效QTL位点连锁的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与花生抗青枯病主效QTL位点连锁的SNP分子标记及其应用。本发明所提供的SNP分子标记BWRB03‑R中SNP多态性位点位于如SEQ ID NO.1所示序列的第201位，多态性为G/A。具体地，SNP分子标记BWRB03‑R中，多态性位点的基因型为A，对应的花生表型为具备较强的青枯病抗性，多态性位点的基因型为G，对应的花生表型为较弱的青枯病抗性。采用本发明提供的SNP分子标记，可以辅助选择抗青枯病的花生材料，有利于推动抗青枯病花生品种的选育，提高育种效率。

技术领域

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与花生抗青枯病主效 QTL位点qBWRB03连锁的SNP分子标记及其应用。

背景技术

花生(Arachis hypogea L.)是重要的油料作物之一。由青枯菌 (Rastoniasolanacearum)引起的青枯病是危害花生生产最重要的细菌性病害。青枯菌从土壤侵入植物根部，沿维管束向上扩展并大量繁殖，最终导致植物导管丧失输水能力而快速枯委死亡。在花生生产中，一般病地的植株病死率为10-30％，重病地的植株病死率可达到80％以上，极端情况下甚至会全部死亡导致绝收。因此，有效地防控青枯病是花生产业发展的重大需求之一。

选育和利用抗病品种是防治花生青枯病最为经济有效的措施之一。花生对青枯病的抗性表型为数量抗性，发掘和利用稳定的主效 QTL是选育抗青枯病品种的关键基础。通过构建重组自交系群体，在多个环境下对青枯病抗性进行鉴定，结合分子标记基因型进行QTL 分析，可鉴定出稳定表达的主效QTL；利用与QTL连锁的分子标记可以进行分子标记辅助选择，提高育种效率。

目前对花生抗青枯病的QTL定位研究还较少，仅在B02染色体上发掘出了稳定的主效QTL及其分子标记。为了进一步提高青枯病抗性水平，发掘和利用新的抗病QTL主效位点至关重要的。

发明内容

本发明的目的是提供检测花生抗青枯病主效QTL位点qBWRB03 的方法，快速判断花生的青枯病抗性。

具体地，本发明第一方面，提供一种花生抗青枯病SNP分子标记 BWRB03-R。更具体地，本发明提供的SNP分子标记BWRB03-R与花生抗青枯病主效QTL位点qBWRB03连锁。

本发明提供的SNP分子标记BWRB03-R，与位于B03染色体上的抗青枯病主效QTL位点qBWRB03紧密连锁。

本发明提供的SNP分子标记BWRB03-R，SEQ ID NO.1所示序列的第201位存在多态性位点G/A。

在所述SNP分子标记BWRB03-R中，具有第201位多态性位点的基因型为A，对应于含有抗青枯病主效QTL位点qBWRB03，基因型为G，对应于不含qBWRB03。

本发明提供的SNP分子标记BWRB03-R，使用SEQ ID NO.2-3所示的引物对扩增得到。

第二方面，本发明提供一种引物对，所述引物对的核苷酸序列如 SEQ ID NO.2-3所示。本发明提供的引物对，用于扩增上述SNP分子标记BWRB03-R。

BWRB03-R的引物对：

正向引物序列5’-ATGAAAAGTGAAAAATGAAAAGTGAAAAG GGA-3’(如SEQ ID NO.2所示)，

反向引物序列5’-CAGCGGGGGCAAGTTCAC-3’(如SEQ ID N O.3所示)。

第三方面，本发明请求保护含有上述引物对的试剂或试剂盒。

根据本领域技术人员的理解，本发明还请求保护上述的SNP分子标记BWRB03-R，或如SEQ ID NO.2-3所示的引物对，或含有SEQ ID NO.2-3所述的引物对的试剂或试剂盒，在检测花生抗青枯病主效 QTL位点qBWRB03中的应用。