[发明专利]一种鉴定红螯螯虾遗传性别的SNP标记及其所用引物对和应用

说明书

本发明提出了一种鉴定红螯螯虾遗传性别的SNP标记及其所用引物对和应用。本发明SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，SNP标记的核苷酸序列中第229bp碱基位置表现为TG杂合的是雌性个体，SNP标记的核苷酸序列中第229bp碱基位置表现为TT纯合的是雄性个体；本发明还给出了上述SNP标记所用的引物对，并给出了上述SNP标记在鉴定红螯螯虾遗传性别中的应用。本发明的SNP标记是与遗传性别相关的SNP标记，通过SNP标记可以成功鉴定红螯螯虾的遗传性别，SNP标记在鉴定雄性红螯螯虾时的成功率超过90％，在鉴定雌性红螯螯虾时的成功率超过80％，从而指导红螯螯虾的育种和养殖，提高经济收益。

技术领域

本发明涉及分子生物学的技术领域，特别是指一种鉴定红螯螯虾遗传性别的SNP标记及其所用引物对和应用。

背景技术

红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)，俗称澳洲淡水龙虾，原产于澳大利亚北部和新几内亚南部，隶属于拟螯虾科，光壳虾属，具有生长快、抗逆强、肉质细嫩、出肉率高等特点，被认为是具有重要经济价值的世界名贵淡水虾之一。两性成熟的红螯螯虾具有明显的性别二态性特征，一方面，雄虾在生长速度和个体大小上优于雌虾；另一方面，与其它经济养殖虾相比，红螯螯虾抱卵量较少(300-700颗/尾)，规模化繁育中雌雄配比高于3:1，为此在生产上需要更多的雌虾来满足养殖户对苗种的需求。然而，目前还没有可以高效的对红螯螯虾的性别进行控制的技术。

遗传标记是指用来区分不同的个体或群体并且能够稳定遗传的物质或性状。SNP(单核苷酸多态性，single nucleotide polymorphism)是指基因组特定位置上一个碱基的变异，且任一种等位基因在种群中的发生频率高于1％，变异的形式包括转换、颠换、插入/缺失等。SNP作为第三代分子标记因其具有数量巨大、分布广泛、共显性、高度稳定、易于自动化规模分析、能够显示其它技术无法检测的隐藏多态性、可能与基因功能相关的众多优点，在分子标记辅助育种中得到广泛应用。

目前，现有技术中没有关于红螯螯虾性别遗传标记的研究或报道。因此，开发与红螯螯虾性别鉴定相关的遗传标记，实施和发展红螯螯虾全雄或全雌育种，可以实现红螯螯虾的单性养殖，提高养殖户的经济收益，对红螯螯虾的育种和养殖具有重要的意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种鉴定红螯螯虾遗传性别的SNP标记及其所用引物对和应用，旨在解决现有技术无法对红螯螯虾的性别进行控制从而导致无法实现红螯螯虾的单性育种，进而影响了红螯螯虾的育种、养殖以及养殖户的经济收益等问题。

为了解决上述技术问题，本发明的技术方案是这样实现的：

在一个方面，本发明的一种鉴定红螯螯虾遗传性别的SNP标记，所述SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述SNP标记的核苷酸序列中第229bp碱基位置表现为TG杂合的是雌性个体，所述SNP标记的核苷酸序列中第229bp碱基位置表现为TT纯合的是雄性个体。

本发明的SNP标记是与遗传性别相关的SNP标记，通过SNP标记可以成功鉴定红螯螯虾的遗传性别，为后续单性育种过程中性逆转个体的鉴定提供理论依据；其中，SNP标记在鉴定雄性红螯螯虾时的成功率超过90％，在鉴定雌性红螯螯虾时的成功率超过80％，能够作为红螯螯虾遗产性别鉴定的分子标记，从而指导红螯螯虾的育种和养殖，实现红螯螯虾的单性育种，实施红螯螯虾的全雄或全雌养殖，提高了养殖户的经济收益。

在另一个方面，本发明的一种用于检测上述鉴定红螯螯虾遗传性别的SNP标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列为：

Fst2-F：5’-TCAGTGCTCTAGTGTCCAACAAGG-3’；

Fst2-R：5’-TGACTAAAACAATACACAGATAAC-3’。