[发明专利]八色系统检测60个人Y-STR和Y-Indel基因座复合扩增试剂盒及应用

说明书

本发明公开了八色系统检测60个人Y‑STR和Y‑Indel基因座复合扩增试剂盒及应用，所述试剂盒包括60个基因座的特异性扩增引物，其中基因座为：DYS392、DYS389I/II、DYS19、DYS438、DYS587、DYS596、DYS522、DYS549、DYS456、DYS447、DYS448、DYS627、DYS508、DYS443、DYS437、DYS446、DYS533、DYS390、DYS385a/b、DYF387S1a/b、DYS622、DYS391、DYS393、Y_GATA_H4、DYS439、DYS630、DYS444、DYS643、DYS527a/b、DYS510、rs199815934、DYS576、DYS458、DYS570、DYS552、DYS518、DYS645、DYF404S1a/b、DYS459a/b、Y_GATA_A10、DYS635、DYS713、DYS460、DYS449、DYS557、DYS531、DYS617、DYS526a/b、DYS481、DYS593、DYS388、DYS520、DYS626。优点为：(1)多出2色荧光通道及合理的基因座排布设计，显著降低基因座越界风险；(2)突破性地同步检测60个基因座，与同类产品相比检测同量样本时可获取更多遗传信息；(3)父系亲缘关系鉴定中，当Y‑STR因突变造成分型不一致时，稳定遗传的Y‑Indel可为亲权关系鉴定辅助性工具。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及法医遗传学、考古学等领域，可应用于远古人群迁徙、Y染色体DNA数据库建立、父系亲缘关系鉴定、家系搜索排查等；具体为八色系统检测60个人Y-STR和Y-Indel基因座复合扩增试剂盒及应用。

背景技术

分子生物学中分子标记的概念可分为广义和狭义，广义分子标记指可稳定遗传并用于检测的DNA序列或蛋白质；狭义分子标记指能反映生物个体或种群间基因组中某种特异性差异的DNA片段。本发明涉及的分子标记属于狭义范畴，本领域常用的分子标记有限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)、重复区十到几百核苷酸的数目可变串联重复序列又称小卫星(Mini-satellite DNA)、核心重复区为3-6碱基的短串联重复序列又称微卫星(Short Tandem Repeat,STR)、串联重复核心序列为双核苷酸重复的简单重复序列(Simple Sequence Repeats,SSR)、插入/缺失多态性(deletion/insertion polymorphisms,DIP)、核苷酸多态性(Single NucleotidePolymorphism,SNP)及联合使用的DIP-STR。

按照片段大小适当，在染色体中分布较广且遗传信息相对稳定的标准从Y染色体上选择了STR和DIP(即Indel)作为分子标记检测。STRs代表了相对较高的突变率(平均突变率在5×10^-3)具有较高的单倍型多样性，可进行法医学个体识别、亲子鉴定及DNA家谱构建等。Indels代表低突变率(平均突变率在3×10^-8),遗传稳定且有很强的群体特异性，能清晰记录群体历史，研究群体父系祖先迁徙史，适用于群体间遗传关系的研究。

随着对Y-STR及Y-Indel遗传标记的不断深入研究以及法医遗传学的不断发展，公安部也根据已经建立的DNA数据库及主流的STR检测试剂盒产品推出了中华人民共和国公共安全行业标准—法庭科学DNA数据库选用的基因座及其数据结构。标准中推荐了3类基因座，核心基因座、优选基因座、备选基因座。