[发明专利]一种发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法在审

专利信息
申请号: 202111619585.1 申请日: 2021-12-27
公开(公告)号: CN114214352A 公开(公告)日: 2022-03-22
发明(设计)人: 刘振云;郭涛 申请(专利权)人: 黄山同兮生物科技有限公司
主分类号: C12N15/72 分类号: C12N15/72;C12N15/56;C12P19/00;C12N1/21;C12R1/19
代理公司: 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 代理人: 孙周强
地址: 245700 安徽省*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 一种 发酵 乳糖 大肠杆菌 基因组 优化 方法
【权利要求书】:

1.一种发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法,其特征在于,包括以下步骤:在pTargetF质粒中引入用于定位Cas9蛋白切割位点的双N20序列以及包含lacY调控序列的重组同源模板,得到pTargetT质粒;之后将已经转入pCas质粒的本底菌株使用阿拉伯糖诱导,再转入pTargetT质粒,经过培养鉴定后消除pCas与pTargetT,完成发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化。

2.根据权利要求1所述发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法,其特征在于,设计待敲除序列的前N20序列、后N20序列,并设计包含前N20序列的引物对、包含后N20序列的引物对;再利用包含前N20序列的引物对、包含后N20序列的引物对在pTargetF质粒中引入用于定位Cas9蛋白切割位点的双N20序列。

3.根据权利要求1所述发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法,其特征在于,所述调控lacY表达水平的短片段为BBa_B0030、BBa_B0032、BBa_B0034、BBa_J61101或其它RBS中的一种。

4.根据权利要求1所述发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法,其特征在于,本底菌株为改造的大肠杆菌菌株,也可以为未改造的大肠杆菌菌株。

5.根据权利要求4所述发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法,其特征在于,本底菌株为lacZΔM15lacZ基因型的大肠杆菌。

6.根据权利要求1所述发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法,其特征在于,以本底菌株的基因组为模板,分别利用HDL引物对、HDR引物对进行扩增,分别得到HDL扩增产物、HDR扩增产物;将HDL扩增产物、HDR扩增产物引入pTargetF质粒中,实现在pTargetF质粒中引入包含lacY调控序列的重组同源模板。

7.根据权利要求1所述发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法,其特征在于,将pCas质粒转入本底菌株感受态细胞,抗性板培养后挑选单克隆,于卡那霉素抗性LB中培养后转接,使用阿拉伯糖诱导培养,随后制备成电转感受态细胞并导入编辑质粒;培养后挑选单克隆鉴定,消除pCas与pTargetT,完成发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化。

8.根据权利要求1所述发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法得到的改造菌株。

9.利用权利要求8所述改造菌株发酵乳糖的方法,其特征在于,在发酵罐中,以所述改造菌株构建发酵菌株,再发酵乳糖,完成乳糖的发酵。

10.权利要求8所述改造菌株在发酵乳糖中的应用。

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