[发明专利]一种用于检测结直肠腺瘤的标志组合物及其早期诊断试剂在审
| 申请号: | 202111565550.4 | 申请日: | 2021-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN114561465A | 公开(公告)日: | 2022-05-31 |
| 发明(设计)人: | 吴春燕;张笑笑;陈煜庶;王美丛;刘晶 | 申请(专利权)人: | 上海锐翌生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京普睿益思知识产权代理事务所(普通合伙) 32475 | 代理人: | 马晓武 |
| 地址: | 200000 上海市闵行区*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 检测 直肠 腺瘤 标志 组合 及其 早期 诊断 试剂 | ||
1.一种用于结直肠进展期腺瘤检测的试剂,其特征在于,包括检测SYNPR基因、MEGF10基因、LSM2基因、SLC32A1基因中至少一个的甲基化状态或水平的试剂。
2.根据权利要求1所述用于结直肠进展期腺瘤检测的试剂,其特征在于,甲基化状态或水平的检测通过检测样本中SYNPR基因、MEGF10基因、LSM2基因、SLC32A1基因的至少一个特定甲基化位点获得,具体如下:
SYNPR基因的特定甲基化位点为位于3号染色体转录起始区的cg09462808、cg04785972和/或cg06314761甲基化位点,该CpG位点及其上下游200bp的DNA碱基序列如SEQ ID NO:1所示;
MEGF10基因的特定甲基化位点为位于5号染色体转录起始区的cg08874609、cg04609576和/或cg23018092甲基化位点,该CpG位点及其上下游200bp的DNA碱基序列如SEQ ID NO:2所示;
LSM2基因的特定甲基化位点为位于6号染色体外显子区的cg13806231、cg01937314、cg07935151和/或cg07797068甲基化位点,该CpG位点及其上下游200bp的DNA碱基序列如SEQ ID NO:3所示;
SLC32A1基因的特定甲基化位点为20号染色体转录起始区的cg07033372、cg25307168和/或cg12180703甲基化位点,该CpG位点及其上下游200bp的DNA碱基序列如SEQ ID NO:4所示。
3.根据权利要求1所述用于结直肠进展期腺瘤检测的试剂,其特征在于,包括:用于检测SYNPR基因甲基化状态或水平的至少一组特异性引物对和至少一个特异性探针;
第一引物对的核酸序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示,
第二引物对的核酸序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示,
第三引物对的核酸序列如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示,
第四引物对的核酸序列如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示,
第五引物对的核酸序列如SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示,
所述探针的核酸序列如SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:39所示。
4.根据权利要求1所述用于结直肠进展期腺瘤检测的试剂,其特征在于,包括:用于检测MEGF10基因甲基化状态或水平的至少一组特异性引物对和探针;
第六引物对的核酸序列如SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16所示,
第七引物对的核酸序列如SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18所示,
第八引物对的核酸序列如SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20所示,
第九引物对的核酸序列如SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22所示,
第十引物对的核酸序列如SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:24所示,
所述探针的核酸序列如SEQ ID NO:40所示。
5.根据权利要求1所述用于结直肠进展期腺瘤检测的试剂,其特征在于,包括:用于检测LSM2基因甲基化状态或水平的至少一组特异性引物对和探针;
第十一引物对的核酸序列如SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26所示,
第十二引物对的核酸序列如SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:28所示,
第十三引物对的核酸序列如SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:30所示,
第十四引物对的核酸序列如SEQ ID NO:31和SEQ ID NO:32所示,
第十五引物对的核酸序列如SEQ ID NO:33和SEQ ID NO:34所示,
所述探针的核酸序列如SEQ ID NO:41所示。
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