[发明专利]一种用于检测JPH3基因的引物对、试剂盒及检测方法在审

专利信息
申请号: 202111473314.X 申请日: 2021-12-02
公开(公告)号: CN114182006A 公开(公告)日: 2022-03-15
发明(设计)人: 伍建;姬晓雯;武璇 申请(专利权)人: 迈基诺(重庆)基因科技有限责任公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京星通盈泰知识产权代理有限公司 11952 代理人: 葛战波
地址: 400026 重庆市江北区港城东环路6*** 国省代码: 重庆;50
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 jph3 基因 引物 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的引物对,其特征在于,所述引物对的正向引物的5’端和反向引物的5’端中的至少一端由荧光基团标记,所述引物对序列如下:

JPH3-famF:GGCAGAGCCGGGGCCGG;

JPH3-R:GGTTCCCTGCACAGAAACCATC。

2.根据权利要求1所述用于检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的引物对,其特征在于,所述引物对famF向引物5’端带5’-FAM荧光基团。

3.一种用于检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的引物对。

4.根据权利要求3所述用于检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括25体积份的2xGoldStar Best MasterMix、2.4体积份的DMSO、13.6体积份的无核酸酶纯化水和4体积份权利要求1所述的引物对。

5.一种检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的非诊断目的的检测方法,其特征在于,包括:

1)提取DNA并利用权利要求1所述的引物对进行PCR扩增;

2)对所述步骤1)PCR扩增后的产物进行毛细管电泳;

3)分析JPH3基因中CTG重复情况。

6.根据权利要求5所述检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的非诊断目的的检测方法,其特征在于,所述步骤1)PCR扩增包括:

按DNA检测样本数量配置扩增反应液混合液,所述扩增反应液混合液中:2×GoldStarBest Master Mix试剂用量25×nμl;10uM的JPH3-famF引物用量2×nμl;10uM的JPH3-R引物用量2×nμl;DMSO用量2.4×nμl;ddH2O用量13.6×nμl;所述n=检测样本数+1;按45ul扩增反应混合液中加入5ulDNA;进行PCR扩增。

7.根据权利要求6所述检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的非诊断目的的检测方法,其特征在于,所述PCR扩增包括:

在PCR仪中先以95℃变性1分钟;再运行35次如下循环:94℃变性30秒、59℃退火30秒、72℃延伸1分钟;之后72℃延伸5分钟,4℃保存。

8.根据权利要求5所述检测JPH3基因CTG重复序列动态突变的非诊断目的的检测方法,其特征在于,所述步骤2)对所述步骤1)PCR扩增后的产物进行毛细管电泳包括:

对PCR扩增产物进行稀释,在ddH2O中加入PCR扩增产物;取ABI GS500-LIZ内标和HIDI按1∶250的体积比混合后,取混合液与稀释后的PCR扩增产物混合制成上机混合液;将配置好的上机混合液在PCR仪上以95℃运行3分钟后,冰水混合物中冷却5分钟,温度为0℃,作变性处理;

上机混合液在ABI3730xl测序仪中进行检测,采用G5颜色分组,在ABI3730xl测序仪中的分型参数设置如下:检测恒温OVEN_Temperature 60℃,缓冲液温度Buffer_Temperature35℃;预电泳电压PreRun_Voltage 15kV,预电泳时间PreRun_Time 180s;注入电压Injection_Voltage为1.5kV;注入时间Injection_Time为15s;第一次读数First_ReadOut_Time 300ms;第二次读数Second_ReadOut_Time 300ms;电泳电压Run_Voltage 15kV;突跳步数Voltage_Number_of_steps设置为10步;突跳电压Voltage_steps_Interval设置为20s;电压容差Voltage_Tolerance设置为0.6kV;电流Current_Stability为30uA,变温延迟Ramp_Delay 1s;日期延迟Data_Delay 600s;电泳时间Run_Time 1600s。

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