[发明专利]一种冬瓜果面蜡粉基因的CAPS分子标记及其应用

说明书

本发明属于分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种冬瓜果面蜡粉基因的CAPS分子标记及其应用，本发明公开的冬瓜果面蜡粉基因的CAPS分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第1370位碱基是SNP位点，其碱基为G或A。同时，采用上述CAPS分子标记的引物能同时产生果面有蜡粉材料的特异性标记和果面无蜡粉材料的特异性标记，且重复性好，特异性强。将本发明开发的冬瓜果面蜡粉基因CAPS分子标记用于鉴定冬瓜的果面蜡粉表型，尤其是用于苗期快速鉴定冬瓜的果面蜡粉表型，具有准确、快速、成本低、鉴定周期短，操作简便等优点，能够辅助冬瓜新品种选育。

技术领域

本发明属于分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种冬瓜果面蜡粉基因的CAPS分子标记及其应用。

背景技术

冬瓜(Benincasa hispida Cogn.)为葫芦科冬瓜属一年生草本植物，原产于我国南方和印度，全国各地均有栽培。冬瓜脆爽多汁，营养成分丰富，耐贮藏运输，耐热性强，是适于现代化农产品加工的良好原料，同时还具有利尿、清热、化痰、解渴等功效，在医药领域中也有着广泛的用途。

根据老熟冬瓜果面蜡粉的有无，可将冬瓜分为粉皮冬瓜和青皮冬瓜两种表型。不同地区对冬瓜类型的喜好不同，其中华南地区以青皮冬瓜为主，四川、江西、湖南等省份则以粉皮冬瓜为主。此外，冬瓜果面蜡粉在果实耐储性和抗病性等方面也发挥着重要的作用。可见，冬瓜果面蜡粉是冬瓜育种过程中的重要性状之一。

然而，由于果面蜡粉是冬瓜果实成熟期才显现的外观性状，因此在传统育种过程中，需要等到果实成熟期才能进行针对性选育，这种育种方法不仅耗时耗力，且效率低下。因而，有必要开发与冬瓜蜡粉性状紧密连锁的分子标记，以便于直接在育苗期进行大规模筛选，从而缩小育种群体，提高育种效率。

发明内容

为了克服上述现有技术的不足，本发明的首要目的是提供一种冬瓜果面蜡粉基因的CAPS分子标记，可用于冬瓜果面蜡粉表型的鉴定。

本发明的第二个目的是提供用于扩增上述CAPS分子标记的引物，该引物能产生有蜡粉材料特异性标记和无蜡粉材料特异性标记(共显性标记)，重复性好，特异性强。

本发明的第三个目的是提供上述的CAPS分子标记，或者上述的CAPS分子标记引物在冬瓜果面蜡粉表型选育中的应用。

本发明的第四个目的是提供一种冬瓜果面蜡粉有无的鉴定方法。该方法具有准确、快速、成本低、鉴定周期短，操作简便等优势。

本发明的上述第一个目的是通过以下技术方案来实现的：

一种冬瓜果面蜡粉基因的CAPS分子标记，所述CAPS分子标记的核苷酸序列如SEQID NO.1所示，SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第1370位碱基为SNP位点，所述SNP位点为G或A。

本发明的上述第二个目的是通过以下技术方案来实现的：

用于扩增上述CAPS分子标记的引物，所述引物包括上游引物和下游引物。

优选地，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

本发明的上述第三个目的是通过以下技术方案来实现的：

上述的CAPS分子标记，或者上述的CAPS分子标记引物在冬瓜果面蜡粉表型选育中的应用。

本发明的上述第四个目的是通过以下技术方案来实现的：

一种冬瓜果面蜡粉有无的鉴定方法，包括以下步骤：

S1、以冬瓜基因组DNA为模板，采用权利要求2或3的CAPS分子标记引物进行PCR扩增，对PCR扩增产物酶切后进行电泳分析：