[发明专利]与草鱼性状相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202111269404.7 | 申请日: | 2018-12-30 |
公开(公告)号: | CN113957155B | 公开(公告)日: | 2023-06-13 |
发明(设计)人: | 樊佳佳;马冬梅;姜鹏;白俊杰 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 林德强 |
地址: | 510380 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 草鱼 性状 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.检测SNP分子标记的引物在选育体重优异的草鱼品种中的应用,
所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO.2所示,SNP位点位于第410位,多态性为C/T;
若检测草鱼基因序列SEQ ID NO.2的第410位碱基处的SNP位点的基因型是CC,则挑选繁殖。
2.一种筛选体重优异的草鱼的方法,其特征在于,包括以下步骤:
检测草鱼基因序列SEQ ID NO.2的第410位碱基处的SNP位点是否为基因型CC,若是,则挑选繁殖。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取草鱼的DNA;
(2)以提取的DNA为模板,进行PCR扩增实验,获取含有SNP位点的目标片段,检测草鱼基因SEQ ID NO.2第410位碱基的基因型是否为CC。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,
所述的步骤(2)中PCR扩增:使用SNP35-F及SNP35-R引物对进行PCR扩增,得到PCR产物,所述引物的核苷酸序列如下:
SNP35-F:5'-GATATGGATGACTGTCTCTCC -3'(SEQ ID NO.7);
SNP35-R:5'-CAATCCAGGTCAGATAGTACA -3'(SEQ ID NO.8);
再将PCR产物使用延伸引物SNP35-P进行PCR延伸扩增,确定草鱼基因SEQ ID NO.2第410位碱基处的基因型;所述延伸引物核苷酸序列如下:
SNP35-P:5'-GTGAAAGGGGGAATACTATAAC-3'(SEQ ID NO.14)。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述的PCR扩增体系为:
DNA 1μl;
10×buffer 1.5μl;
25mM 的 MgCl2 1.5μl;
10mM 的 dNTP 0.3μl;
上游引物、下游引物各 0.15μl;
Taq 酶0.3μl;
H2O补至 15μl;
所述的PCR扩增反应条件为:94℃变性15s;54℃退火15s,72℃延伸30s,24个循环。
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