[发明专利]与小麦粒长主效QTL连锁的SNP分子标记KASP-BE-kl-sau2及应用

权利要求书

1.一种与小麦粒长QTL Qkl .sau-BE-4A连锁的SNP分子标记KASP-BE-kl-sau2，其特征在于，所述KASP-BE-kl-sau2的多态性为C/T，所述KASP-BE-kl-sau2与小麦粒长QTL Qkl.sau-BE-4A共定位于小麦4A染色体短臂上，且位于QTL Qkl .sau-BE-4A区间内，所述QTLQkl .sau-BE-4A位于小麦4A染色体短臂上在RefSeqv2.0基因组版本的物理位置为101.7-109.2Mbp；所述KASP-BE-kl-sau2通过核苷酸序列如SEQ ID NO：4-6所示的引物扩增得到。

2.一种引物组，其特征在于，包括用于扩增权利要求1所述KASP-BE-kl-sau2的两条特异性引物和一条通用引物，两条所述特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：4-5所示，所述通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示。

3.一种检测小麦全基因或其基因片段的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1所述的KASP-BE-kl-sau2或权利要求2所述的引物组。

4.一种权利要求1所述的KASP-BE-kl-sau2或权利要求2所述的引物组或权利要求3所述的试剂盒的应用，其特征在于，用于如下任一项应用中：

(1)筛选具有合适粒长的小麦品种或品系；

(2)调控小麦粒长性状； (3)小麦粒长基因遗传分析或遗传精细定位。

5.一种筛选含有粒长QTL Qkl .sau-BE-4A的小麦株系方法，其特征在于，包括以下步骤：以待测植株样品的基因组DNA作为模板，利用权利要求2所述的引物组对模板进行荧光定量PCR扩增，利用扩增结果进行基因型分型。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，荧光定量PCR扩增反应体系为：7.5μLMasterMix、2.1μL混合引物、6ng模板DNA、双蒸水加至总量为15μL；其中，所述混合引物是由如SEQ ID NO：4-SEQ ID NO：6所示引物均按照10ng/μL的浓度，分别加入120μL、120μL和300μL，并添加460μL ddH₂O进行混合后制备而成。

7.如权利要求5所述的方法，其特征在于，荧光定量PCR扩增反应程序为：94℃预变性15min；94℃变性20s、60℃复性/延伸50s，共8个循环；94℃变性20s、55℃复性/延伸60s，共28个循环。

8.如权利要求5所述的方法在小麦长籽粒品种选育中的应用。

9.一种小麦KASP-BE-kl-sau2分子标记或粒长基因QTL Qkl .sau-BE-4A在调控小麦粒长性状中的应用，其特征在于，所述KASP-BE-kl-sau2的多态性为C/T，所述KASP-BE-kl-sau2与小麦粒长QTL Qkl .sau-BE-4A共定位于小麦4A染色体短臂上，且位于QTL Qkl.sau-BE-4A区间内，所述QTL Qkl .sau-BE-4A位于小麦4A染色体短臂上在RefSeqv2.0基因组版本的物理位置为101.7-109.2Mbp；所述KASP-BE-kl-sau2通过核苷酸序列如SEQ IDNO：4-6所示的引物扩增得到。