[发明专利]一种筛查红系转录因子EKLF基因突变的方法及其应用有效

专利信息
申请号: 202111136730.0 申请日: 2021-09-27
公开(公告)号: CN113621700B 公开(公告)日: 2023-10-27
发明(设计)人: 刘顿;余丽华;刘风华;张曦倩 申请(专利权)人: 广东省妇幼保健院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 沈阳亚泰专利商标代理有限公司 21107 代理人: 史力伏
地址: 510000 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 筛查红系 转录 因子 eklf 基因突变 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的PCR引物组,其特征在于,所述引物组包括9对引物,详述如下:

(1)EKLF基因启动子区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2;

(2)EKLF基因外显子1区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4;

(3)EKLF基因外显子2-1区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6;

(4)EKLF基因外显子2-2区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8;

(5)EKLF基因外显子2-3区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10;

(6)EKLF基因外显子2-4区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12;

(7)EKLF基因外显子3区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14;

(8)EKLF基因3'UTR-1区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16;

(9)EKLF基因3'UTR-2区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18。

2.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测反应体系,其特征在于,所述反应体系含有权利要求1所述的一组或几组的PCR引物组。

3.根据权利要求2所述的检测反应体系,其特征在于,所述反应体系还包括阴性质控品、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、LC Green、Betain、去离子水和DMSO;所述dNTPs混合物包括dATP、dTTP、dGTP和dCTP。

4.根据权利要求3所述的检测反应体系,其特征在于,所述DNA聚合酶为广州鼎国生物Taq DNA聚合酶。

5.根据权利要求3所述的检测反应体系,其特征在于,所述Betain为5M。

6.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1所述的一组或几组的PCR引物组。

7.根据权利要求6所述的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含权利要求3所述的检测反应体系。

8.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括如下步骤:

(1)待测样本DNA准备:采集被检测者外周血标本,采用柱式法提取样本DNA;

(2)高分辨率熔解曲线反应体系:

10μLPCR反应体系包括:10×Taq buffer(含20mMMg2+)1.0μL,2.5nM dNTPs 0.4μL,5U/μlTaq DNA聚合酶0.2μL,10μM上下游引物0.6μL,1×LC Green 1μL,模板DNA0.8μL,5MBetain 2.0μL,DMSO 1.0μL,去离子水3.0μL;

(3)PCR反应程序:

按照特定的循环条件在PCR仪上进行,95℃预变性5分钟;95℃ 30秒,63-68℃ 30秒,72℃ 30秒,共45个循环;95℃ 1分钟,4℃保温;

(4)PCR扩增完成后在高分辨率熔解曲线分析仪(LightScanner HRⅠ96)上进行检测荧光,起始温度为55℃,终止温度为98℃和待机温度为42℃;横坐标为温度,纵坐标为相对荧光强度。

9.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒在检测样本中EKLF基因突变中的应用。

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