[发明专利]一种筛查红系转录因子EKLF基因突变的方法及其应用有效
| 申请号: | 202111136730.0 | 申请日: | 2021-09-27 |
| 公开(公告)号: | CN113621700B | 公开(公告)日: | 2023-10-27 |
| 发明(设计)人: | 刘顿;余丽华;刘风华;张曦倩 | 申请(专利权)人: | 广东省妇幼保健院 |
| 主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 沈阳亚泰专利商标代理有限公司 21107 | 代理人: | 史力伏 |
| 地址: | 510000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 筛查红系 转录 因子 eklf 基因突变 方法 及其 应用 | ||
1.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的PCR引物组,其特征在于,所述引物组包括9对引物,详述如下:
(1)EKLF基因启动子区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2;
(2)EKLF基因外显子1区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4;
(3)EKLF基因外显子2-1区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6;
(4)EKLF基因外显子2-2区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8;
(5)EKLF基因外显子2-3区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10;
(6)EKLF基因外显子2-4区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12;
(7)EKLF基因外显子3区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14;
(8)EKLF基因3'UTR-1区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16;
(9)EKLF基因3'UTR-2区域上下游引物分别为:SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18。
2.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测反应体系,其特征在于,所述反应体系含有权利要求1所述的一组或几组的PCR引物组。
3.根据权利要求2所述的检测反应体系,其特征在于,所述反应体系还包括阴性质控品、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、LC Green、Betain、去离子水和DMSO;所述dNTPs混合物包括dATP、dTTP、dGTP和dCTP。
4.根据权利要求3所述的检测反应体系,其特征在于,所述DNA聚合酶为广州鼎国生物Taq DNA聚合酶。
5.根据权利要求3所述的检测反应体系,其特征在于,所述Betain为5M。
6.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1所述的一组或几组的PCR引物组。
7.根据权利要求6所述的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含权利要求3所述的检测反应体系。
8.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括如下步骤:
(1)待测样本DNA准备:采集被检测者外周血标本,采用柱式法提取样本DNA;
(2)高分辨率熔解曲线反应体系:
10μLPCR反应体系包括:10×Taq buffer(含20mMMg2+)1.0μL,2.5nM dNTPs 0.4μL,5U/μlTaq DNA聚合酶0.2μL,10μM上下游引物0.6μL,1×LC Green 1μL,模板DNA0.8μL,5MBetain 2.0μL,DMSO 1.0μL,去离子水3.0μL;
(3)PCR反应程序:
按照特定的循环条件在PCR仪上进行,95℃预变性5分钟;95℃ 30秒,63-68℃ 30秒,72℃ 30秒,共45个循环;95℃ 1分钟,4℃保温;
(4)PCR扩增完成后在高分辨率熔解曲线分析仪(LightScanner HRⅠ96)上进行检测荧光,起始温度为55℃,终止温度为98℃和待机温度为42℃;横坐标为温度,纵坐标为相对荧光强度。
9.一种以高分辨率熔解曲线技术为基础检测EKLF基因突变的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒在检测样本中EKLF基因突变中的应用。
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