[发明专利]小麦每穗小穗数及穗粒数性状相关SNP位点及其应用

权利要求书

1.一种试剂盒，用于检测小麦基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性，所述SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第324bp基因起始编码位点A算起的第1010位碱基；

所述SNP位点处的核苷酸为G或A；所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时，相对应的基因型是甲；所述SNP位点处的核苷酸为A/A纯合时，相对应的基因型是乙；

所述试剂盒包含SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，和SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R。

2.一种引物，用于检测小麦基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性，所述的SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第324bp基因起始编码位点A算起的第1010位碱基；所述SNP位点处的核苷酸为G或A；所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时，相对应的基因型是甲；所述SNP位点处的核苷酸为A/A纯合时，相对应的基因型是乙；

所述引物为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，和SEQ ID NO.4和SEQID NO.5组成的引物对2F和2R。

3.一种鉴定或辅助鉴定小麦穗粒数性状的方法，其特征在于：该方法包括如下步骤：

A、对待测小麦基因组DNA中任意一段包含如下SNP位点的DNA片段进行PCR扩增，并将该PCR扩增产物进行酶切鉴定；所述SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第324bp基因起始编码位点A算起的第1010位碱基；

B、确定待测小麦的基因型，所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时，相对应的基因型是甲；所述SNP位点处的核苷酸为A/A纯合时，相对应的基因型是乙；

C、根据待测小麦基因型按照如下标准确定待测小麦的穗粒数性状：基因型甲纯合小麦的穗粒数小于或候选小于基因型乙纯合小麦的穗粒数；

步骤A中：所述的PCR扩增的DNA片段为SEQ ID NO.1中5’末端989-1144bp；所述的PCR扩增的特异性引物对为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，SEQ ID NO.4和SEQID NO.5组成的引物对2F和2R；所述的酶切包括以下步骤：以小麦基因组DNA为模板，以引物1F和1R为引物对扩增得到第一PCR产物；将此第一PCR产物稀释10倍，以其作为模板，以引物2F和2R为引物对扩增得到第二PCR产物；用限制性内切酶PstI酶切第二PCR产物；

步骤B中：若第二PCR产物可以被切开，则核苷酸多态性位点为G/G；若第二PCR产物不能被切开，则核苷酸多态性位点为A/A。