[发明专利]细胞荧光图像阈值化方法、系统、终端及存储介质

说明书

本申请涉及一种细胞荧光图像阈值化方法、系统、终端以及存储介质。所述方法包括：利用限制对比度自适应局部直方图均衡算法调整细胞荧光图像的像素值分布；对所述像素值分布调整后的细胞荧光图像进行双边滤波处理；利用大津法对所述双边滤波处理后的细胞荧光图像进行二值化处理，得到二值化图像；获取所述二值化图像中的连通域，并计算每个连通域的面积，将面积小于设定阈值的连通域消除，得到阈值化细胞荧光图像。本申请实施例有效去除了点光源成像对荧光图像的干扰，并在去除点光源影响的同时保留细胞的边界信息，提高了待分析细胞的数据量，有利于提升后续提取生物参数的准确性。

技术领域

本申请属生物医学图像处理技术邻域，特别涉及一种细胞荧光图像阈值化方法、系统、终端以及存储介质。

背景技术

在细胞实验的同时拍摄荧光图像可以大幅提升对细胞的观测和分析效率。作为细胞标记的一种，对细胞的检测和追踪可以通过对荧光图像的处理自动化地进行，大幅提升了实验的效率。同时，通过对荧光图像中细胞标记的分析可以得到一系列具有生物意义的参数，例如细胞面积、核质比、运动速度、方向等。这些参数对于细胞的行为分析及分类辨识具有重要作用。因此，细胞荧光图像的拍摄具有重要的作用和意义。但是，由于实验平台在拍摄荧光图像时采用的光源是点光源，由此会造成荧光图像的像素值分布中央远大于四周，常规的阈值方法无法同时保留中央和四周的细胞标记。实验学家采取的方法是对荧光图像进行裁切，仅保留下视野中央一小部分区域的图像进行阈值化操作，但在阈值化的过程中细胞标记的边缘信息得不到较好的保留，使得最终获取的生物参数具有一定的误差。同时，裁切操作使得可获得的细胞标记数量大幅减少，为了保证一定的数据量，还需要进一步增加实验操作，增加了操作复杂性。

发明内容

本申请提供了一种细胞荧光图像阈值化方法、系统、终端以及存储介质，旨在至少在一定程度上解决现有技术中的上述技术问题之一。

为了解决上述问题，本申请提供了如下技术方案：

一种细胞荧光图像阈值化方法，包括：

利用限制对比度自适应局部直方图均衡算法调整细胞荧光图像的像素值分布；

对所述像素值分布调整后的细胞荧光图像进行双边滤波处理；

利用大津法对所述双边滤波处理后的细胞荧光图像进行二值化处理，得到二值化图像；

获取所述二值化图像中的连通域，并计算每个连通域的面积，将面积小于设定阈值的连通域消除，得到阈值化细胞荧光图像。

本申请实施例采取的技术方案还包括：所述利用限制对比度自适应局部直方图均衡算法调整细胞荧光图像的像素值分布具体为：

将所述细胞荧光图像分为大小相等的不重叠的子块，每个子块的大小为tileGridSize；

计算细胞荧光图像的完整直方图以及每个子块的直方图，并确定直方图的剪切阈值clipLimit；

将每个子块的直方图中超过剪切阈值clipLimit的像素值均匀地填充到完整直方图中，完成子块直方图中多余像素的重新分配：

通过函数映射对像素填充后的完整直方图进行像素值均衡处理；

采用双线性插值对像素值均衡处理后的完整直方图进行像素点灰度值重构，得到处理后的细胞荧光图像。

本申请实施例采取的技术方案还包括：所述对所述像素值分布调整后的细胞荧光图像进行双边滤波处理具体为：