[发明专利]一种位于猪14号染色体上与母猪死胎数和健仔率相关的SNP分子标记及其用途

说明书

本发明提供了一种位于猪14号染色体上与母猪死胎数和健仔率相关的SNP分子标记及其用途，所述SNP分子标记的位点对应于国际猪参考基因组11.1版本14号染色体上第109497913bp处的TC突变。该分子标记是通过全基因组关联分析得到，可显著影响母猪死胎数和健仔率的性状。本发明还提供了一种用于检测该分子标记的引物对，利用该分子标记和引物对可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于母猪死胎数和健仔率性状遗传改良中，从而降低母猪死胎数并提高健仔率，进而提高能繁母猪的繁殖性能。

技术领域

本发明涉及一种位于猪14号染色体上与母猪死胎数和健仔率相关的SNP分子标记及其用途。

背景技术

母猪的繁殖性能直接影响养殖企业经济效益，而死胎数和健仔率作为母猪的重要经济性状，是衡量母猪繁殖性能的重要指标。众所周知，死胎数与健仔率成负相关，死胎数越低，健仔率就越高。因此，减低母猪死胎数和提高母猪健仔率一直是育种工作者的主要目标。然而，死胎数和健仔率属于低遗传力性状，易受环境因素影响，故通过传统选育对死胎数和健仔率进行遗传改良效果甚微。分子育种为母猪死胎数和健仔率性状遗传改良提供一个新策略，通过在分子水平上进行育种，降低环境因素对目的性状在遗传改良上的影响。分子标记辅助选择(marker assisted selection，MAS)是分子育种的重要技术，通过分子标记对筛选优良品种。如若能利用MAS技术对母猪死胎数和健仔率进行遗传改良，将进一步加快这两个性状的育种进程，提高母猪繁殖性能。目前，普遍采用全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)筛选出与目的性状显著关联的分子标记。

杜长大(杜洛克猪×长白猪×大白猪)是我国主要商品猪之一，杜洛克作为杜长大商品猪的亲本，其繁殖性能直接影响到养殖场的经济效益。因此，对核心群杜洛克母猪的死胎数和健仔率进行遗传改良，提高母猪繁殖性能，进而提高养殖企业的经济效益。本申请拟对杜洛克母猪的死胎数和健仔率进行GWAS分析，以期筛选出有遗传改良价值的分子标记。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的不足和缺点而提供一种位于猪14号染色体上与母猪死胎数和健仔率相关的SNP分子标记，该分子标记是通过全基因组关联分析得到，可显著影响母猪死胎数和健仔率的性状。本发明还提供了一种用于检测所述的SNP分子标记的引物对和试剂盒，利用该分子标记和引物对可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于母猪死胎数和健仔率性状遗传改良中，从而降低母猪死胎数并提高健仔率，进而提高能繁母猪的繁殖性能。本发明还提供了一种筛选低母猪死胎数和高健仔率性状的猪品种的方法，本发明还提供了一种猪的遗传改良的方法。

为实现上述目的，所采取的技术方案：一种位于猪14号染色体上与母猪死胎数和健仔率相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的位点对应于国际猪参考基因组11.1版本14号染色体上第109497913bp处的TC突变。该位点碱基的多态性导致母猪死胎数和健仔率性状的不同。

优选地，所述SNP分子标记的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M是T或C。所述SNP分子标记的位点为SEQ IDNO:1序列标注位置为756位的T756-C756的核苷酸突变(位于该序列片段第756核酸单碱基突变，命名为：g.756TC)。

优选地，所述母猪包括S22系杜洛克及其合成系。

本发明提供了一种用于检测上述所述的SNP分子标记的引物对，其特征在于，包含上游引物primer-F和下游引物primer-R，核苷酸序列如下：

上游引物primer-F：5’-GTTACTTGGGTGACATTG-3’；

下游引物primer-R：5’-CTAAAGGGTTAGTAGTGGT-3’。

本发明提供了一种用于检测上述所述的SNP分子标记的试剂盒，其特征在于，包括上述所述的引物对。