[发明专利]基于全基因组选择的马氏珠母贝金黄壳色性状良种培育方法在审
申请号: | 202110796902.0 | 申请日: | 2021-07-14 |
公开(公告)号: | CN113373245A | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
发明(设计)人: | 邓岳文;王姿曼;郝瑞娟;杨创业;赵子涵;王庆恒;郑哲;杜晓东 | 申请(专利权)人: | 广东海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;A01K61/56 |
代理公司: | 广州市南锋专利事务所有限公司 44228 | 代理人: | 千帆 |
地址: | 524000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 基因组 选择 珠母 金黄 性状 良种 培育 方法 | ||
1.一种基于全基因组选择的马氏珠母贝金黄壳色性状良种培育方法,其特征在于:所述培育方法包括以下步骤:
步骤一,马氏珠母贝金黄壳色性状测定及参考群体构建;
步骤二,对马氏珠母贝金黄壳色性状参考群体进行基因组重测序和全基因组SNP标记鉴定;
步骤三,计算每个SNP标记的效应值,对验证群进行育种值估计;结合验证群的表型值,计算其相关性及回归系数,选出最佳的预测计算模型;
步骤四,利用步骤三选择的最佳预测模型用于育种群育种值估计,并用于最终的选种。
2.根据权利要求1所述的培育方法,其特征在于:所述步骤一中,对马氏珠母贝进行金黄壳色性状测定,依据马氏珠母贝的金黄壳色性状构建参考群体。
3.根据权利要求2所述的培育方法,其特征在于:所述步骤二中,利用基因组重测序方法,测序深度大于10×,进行SNP位点标记鉴定,获得全基因组范围内超高密度SNP位点。
4.根据权利要求3所述的培育方法,其特征在于:所述步骤三中,利用参考群的表型值和基因型信息,加入到基于rrBLUP、BayesA和BayesB分析方法的基因组预测模型,计算每个SNP标记的育种效应值,将rrBLUP、BayesA和BayesB作为基因组选择方法的代表,对三种基因组选择方法的预测准确性进行评估,利用验证群全基因组SNP分型结果和SNP的效应值,计算验证群每个个体的育种值;根据验证群的育种值及表型值,计算两者的相关性及回归系数,筛选其中最佳的基因组预测模型。
5.根据权利要求4所述的培育方法,其特征在于:所述步骤四具体为选用步骤三中确定的预测准确性最高的基因组选择方法,预测育种群体中每个个体的育种值,并根据基因组育种值从高到低进行个体选择。
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