[发明专利]宫颈癌预后标志微生物及其在制备宫颈癌预后预测诊断产品中的应用有效
申请号: | 202110795683.4 | 申请日: | 2021-07-14 |
公开(公告)号: | CN113444803B | 公开(公告)日: | 2022-03-15 |
发明(设计)人: | 杨慧;邱惠;张金方;谢丛华;周云峰 | 申请(专利权)人: | 武汉大学中南医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/689;G16B30/00;G16H50/20;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 | 代理人: | 江慧 |
地址: | 430071 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 宫颈癌 预后 标志 微生物 及其 制备 预测 诊断 产品 中的 应用 | ||
1.一种宫颈癌预后标志微生物组合物,其特征在于,所述宫颈癌预后标志微生物组合物由Dermabacter、Sulfurovum、Nostoc、Thermacetogenium和Alphavirus的5个微生物组成。
2.一种宫颈癌预后标志微生物组合物的丰度测定产品,其特征在于,包括检测权利要求1所述宫颈癌预后标志微生物组合物在宫颈癌组织中的DNA或mRNA丰度的产品。
3.根据权利要求2所述的宫颈癌预后标志微生物组合物的丰度测定产品,其特征在于,所述产品包括:检测宫颈癌预后标志微生物组合物的探针和引物。
4.一种权利要求1所述的宫颈癌预后标志微生物组合物、权利要求2-3所述的宫颈癌预后标志微生物组合物的丰度测定产品在建立预测宫颈癌预后风险预测系统以及制备宫颈癌预后预测诊断产品中的应用。
5.一种宫颈癌预后风险预测系统,其特征在于,所述系统包括:
处理器和存储器,所述存储器耦接到所述处理器,所述存储器存储指令,当所述指令由所述处理器执行时使用以下步骤:
将权利要求1所述的宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度输入如下计算公式中,获得宫颈癌预后风险预测分值;所述计算公式如下:
预测分值=
所述微生物i为权利要求1所述宫颈癌预后标志微生物组合物:由Dermabacter、Sulfurovum、Nostoc、Thermacetogenium和Alphavirus的5个微生物组成;
所述微生物i的丰度为所述宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度;
所述微生物i的系数为将所述宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度进行COX多因素回归分析后获得;
所述宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度的测定方法包括PCR、基因芯片、二代高通量测序、Panomics或Nanostring宏基因组测序中的任意一种或至少两种的组合。
6.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时使用以下步骤:
将权利要求1所述的宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度输入如下计算公式中,经过计算获得宫颈癌预后风险预测分值;所述计算公式如下:
预测分值=
所述微生物i为权利要求1所述宫颈癌预后标志微生物组合物:由Dermabacter、Sulfurovum、Nostoc、Thermacetogenium和Alphavirus的5个微生物组成;
所述微生物i的丰度为所述宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度;
所述微生物i的系数为将所述宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度进行COX多因素回归分析后获得;
所述宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度的测定方法包括PCR、基因芯片、二代高通量测序、Panomics或Nanostring宏基因组测序中的任意一种或至少两种的组合。
7.一种权利要求5所述预测系统在制备预测宫颈癌预后风险产品中的应用。
8.一种宫颈癌预后预测诊断产品,其特征在于,包括:
权利要求1所述宫颈癌预后标志微生物组合物的DNA或mRNA丰度测定产品;
和权利要求5所述的宫颈癌预后风险预测系统或权利要求6所述的计算机可读存储介质。
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