[发明专利]与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记及其应用

说明书

本发明提供了与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记，属于鸡遗传育种、生物技术领域，包括POL_tag9和/或POL_tag17；POL_tag9对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Ga l l us_ga l l us‑GRCg6版本序列信息9号染色体正义链第20037745位，此处碱基为G或A；POL_tag17对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Ga l l us_ga l l us‑GRCg6版本序列信息17号染色体正义链第2186240位，此处碱基为G或A，所述SNP遗传标记有助于遗传上改善蛋鸡后期产蛋数，可用于基因组选择或分子标记辅助选择。本发明还提供与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用。

技术领域

本发明属于鸡遗传育种、生物技术领域，特别涉及与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记及其应用。

背景技术

产蛋数是影响蛋鸡养殖收益的关键因素，是蛋鸡育种的主选性状，也是蛋鸡遗传评估的主要研究内容。随着数量遗传理论的发展和计算技术的进步，蛋鸡产蛋性能不断取得进展，高峰产蛋率已经接近鸡的生理极限。近年来，欧美蛋鸡育种公司将选择目标从高峰产蛋率移向产蛋持续能力。所谓产蛋持续能力，指蛋鸡达到产蛋高峰后，仍维持较高产蛋水平。遗传上提高产蛋持续能力选择强度，可增加后期产蛋数，提升生产效率，减少对环境的冲击(Bain et.al.Increasing persistency in lay and stabilising egg quality inlonger laying cycles.What are the challenges？[J].British Poultry Science,2016,57(3):330-337.)。

产蛋数属于函数值性状，可多次测量。应用随机回归模型分析函数值性状是当前流行趋势，该模型通过构建遗传协方差方程以曲线形式描述目标性状，曲线的峰谷有其生物学意义，要么反应生命体加速生长，要么反应生命体背离原时间线。以随机回归模型解析产蛋数动态变化规律，对遗传效应第二特征值进行选择，可以改变产蛋曲线形状，达到延长蛋鸡使用年限的目的。

近年来，全基因组关联分析(Genome-wide association studies,GWAS)成为解析畜禽数量性状遗传结构强有力工具。利用GWAS方法研究碱基变异与表型值之间的关联，能够鉴别影响经济性状的遗传标记，特别适用于难于测量性状、生命体晚期性状、限性性状以及屠宰性状。若能通过全基因组关联分析筛选鸡产蛋持续能力遗传标记，有助于通过分子标记辅助育种或全基因组选择快速获取遗传进展。

发明内容

为了解决产蛋持续能力强的蛋鸡选育问题，本发明提供了与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记，所述SNP遗传标记有助于遗传上改善蛋鸡后期产蛋数，可用于基因组选择或分子标记辅助选择。

本发明还提供了与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用。

本发明通过以下技术方案实现：

本申请提供与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记，包括POL_tag9和/或POL_tag17；

所述POL_tag9的SNP编号为rs313804988，对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus-GRCg6版本序列信息9号染色体正义链第20037745位，属于SEC62基因第3内含子，此处碱基为G或A；

所述POL_tag17的SNP编号为rs315054405，对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus-GRCg6版本序列信息17号染色体正义链第2186240位，属于PNPLA7基因下游，此处碱基为G或A。

基于同一发明构思，本申请提供与鸡产蛋持续能力相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用。

基于同一发明构思，本申请提供一种鸡产蛋持续能力性状的早期选择方法，基于所述SNP遗传标记的基因型对鸡产蛋持续能力性状进行早期选择。