[发明专利]一种DNA连接的方法及其应用有效
申请号: | 202110737591.0 | 申请日: | 2021-06-30 |
公开(公告)号: | CN113481196B | 公开(公告)日: | 2023-07-04 |
发明(设计)人: | 杨神州;万成;任军 | 申请(专利权)人: | 序康医疗科技(苏州)有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C40B50/06;C12Q1/6851 |
代理公司: | 北京三友知识产权代理有限公司 11127 | 代理人: | 韩蕾;姚亮 |
地址: | 215123 江苏省苏州市工业*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 连接 方法 及其 应用 | ||
1.一种DNA连接用片段,其包括第一DNA片段和/或第二DNA片段,其中:
第一DNA片段选自如下所示核苷酸序列形成的多核苷酸片段:
X1-BAGATCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTGCAT-X3-ATGCACACTCTTTCC CTACACGACGATCT,
第二DNA片段选自如下所示核苷酸序列形成的多核苷酸片段:
TCTAGTGTGCAGACTTGAGGTCAGTGGCAT-X6-ATGCCACTGACCTCAAGT CTGCACACTAGAB-X8;
或者,
第一DNA片段选自如下所示核苷酸序列形成的多核苷酸片段:
X1-BAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC-X3-GTTCAGACGTGTGCTCTTC CGATCT,
第二DNA片段选自如下所示核苷酸序列形成的多核苷酸片段:
TCTAGCCTTCTCGCAGCACATCCC-X6-GGGATGTGCTGCGAGAAGGCTAG AB-X8;
其中,X1为12-50个任意核酸N;
X3为6-15个T碱基;
X6为6-15个T碱基;
X8为12-50个任意核酸N。
2.根据权利要求1所述的DNA连接用片段,其中,第二DNA片段5’端带有磷酸化修饰,3’端带有封闭基团修饰。
3.权利要求1-2任一项所述的DNA连接用片段作为接头用于DNA定量测定或构建测序文库中的DNA连接的应用。
4.根据权利要求3所述的应用,其中,DNA连接时按照3’端至5’端的顺序形成第一DNA片段-待测DNA-第二DNA片段的结构。
5.一种DNA连接方法,该方法包括:
将待测DNA经过酶切后,在DNA连接酶的作用下与权利要求1-2任一项所述的DNA连接用片段进行连接。
6.根据权利要求5所述的方法,其中,DNA连接时按照3’端至5’端的顺序形成第一DNA片段-待测DNA-第二DNA片段的结构。
7.根据权利要求5所述的方法,其中,酶切时选用Tn5转座酶、Fragmentase、DNase I、Endonuclease V中的一种或多种DNA内切酶;
DNA连接酶选自HiFi Taq DNA Ligase、Taq DNA Ligase、9°NTMDNA Ligase中的一种或多种,酶的工作浓度为0.01U/μl~0.2U/μl。
8.根据权利要求5所述的方法,其中,DNA连接用片段的工作浓度为0.01uM~0.2uM。
9.一种DNA定量测定方法,该方法包括:
按照权利要求5-8任一项所述的方法对待测DNA进行连接;
连接产物进行PCR扩增,从而进行定量测定。
10.一种DNA文库构建方法,该方法包括:
按照权利要求5-8任一项所述的方法对待测DNA进行连接;
连接产物进行PCR扩增,从而构建DNA文库。
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