[发明专利]一种检测筛查新冠病毒N439K突变的方法及试剂盒有效
申请号: | 202110650114.0 | 申请日: | 2021-06-10 |
公开(公告)号: | CN113308575B | 公开(公告)日: | 2022-04-01 |
发明(设计)人: | 邢晨;杜忆南;柳燕;周静;祝亚亭;王小凤;李倩;张宁;王悦晨 | 申请(专利权)人: | 安徽医科大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6858;C12R1/93 |
代理公司: | 苏州翔远专利代理事务所(普通合伙) 32251 | 代理人: | 王华 |
地址: | 230000*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 筛查新冠 病毒 n439k 突变 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测筛查新冠病毒N439K突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括:
两组RT-RAA扩增引物:
RT-RAA上游引物为:
5’-GAAATTAATACGACTCACTATAGGGcgctccagggcaaactggaaagattgctg-3’;
则RT-RAA下游引物为:5’-aaggtttgagattagacttcctaaacaatc-3’;
或者:
RT-RAA上游引物为:
5’-cgctccagggcaaactggaaagattgctg-3’;
则RT-RAA下游引物为:5’-aaggtttgagattagacttcctaaacaatc-3’;
三种CRISPR特异性检测的crRNA:
K1 crRNA :
5’- gauuuagacuaccccaaaaacgaaggggacuaaaacagaaucuuagaauuccaagcuauaacgc -3’;
P1 crRNA:
5’- gauuuagacuaccccaaaaacgaaggggacuaaaacagaauuuuagaauuccaagcuauaacgc-3’;
B2 crRNA:
5’-uaauuucuacuaaguguagauagaauuccaagcuauaacgc-3’;
RNA荧光探针:
5’-FAM-mArArUrGrGrCmAmArArUrGrGrCmA-BHQ1-3’;
其中,m代表2位氧甲基修饰,r代表核糖核苷酸;
DNA荧光探针:
5’ -FAM-TTATTATT-BHQ1-3’。
2.根据权利要求1所述的检测筛查新冠病毒N439K突变的试剂盒,其特征在于:还包括buffer A溶液和BufferB溶液;buffer A溶液配置方法为:向1L水中加入50mmol的Tris缓冲液,100nmol的醋酸钾,20g的聚乙二醇粉末和2mmol二硫苏糖醇;BufferB溶液为浓度为280mM的醋酸镁溶液。
3.根据权利要求1所述的检测筛查新冠病毒N439K突变的试剂盒,其特征在于:还包括:HEPES缓冲液、MgCl2溶液、10×NEB buffer2.1缓冲液、RNase inhibitor、T7 RNApolymerase、无RNA酶水。
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