[发明专利]一种检测早期iPSCs质量的方法、存储介质及装置在审
申请号: | 202110553855.7 | 申请日: | 2021-05-20 |
公开(公告)号: | CN113421221A | 公开(公告)日: | 2021-09-21 |
发明(设计)人: | 汪天富;李明珠;雷柏英;岳广辉;周光前;廖进齐 | 申请(专利权)人: | 深圳大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06K9/46;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 | 代理人: | 徐凯凯 |
地址: | 518061 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 早期 ipscs 质量 方法 存储 介质 装置 | ||
1.一种检测早期iPSCs质量的方法,其特征在于,包括步骤:
获取iPSCs菌落明场显微图像,并根据iPSCs菌落的生长情况对iPSCs菌落明场显微图像进行标记,得到标记后iPSCs菌落明场显微图像;
采用所述标记后iPSCs菌落明场显微图像对基于EfficientDet的目标检测模型进行训练,得到已训练目标检测模型;
将待测iPSCs菌落明场显微图像样本输入所述已训练目标检测模型,输出带有预测类别和边界框的图像。
2.根据权利要求1所述检测早期iPSCs质量的方法,其特征在于,根据iPSCs菌落的生长情况对iPSCs菌落明场显微图像进行标记的步骤包括:
人工观察iPSCs菌落明场显微图像,并在第13天质量评价标准中根据iPSCs菌落的生长情况进行标记;
对iPSCs培养过程中,若在第13天的iPSCs菌落明场显微图像中目标位置无菌落形成,则在第9天的iPSCs菌落明场显微图像中对应位置标记质量差;若在第13天的iPSCs菌落明场显微图像中目标位置形成菌落,则在第9天的iPSCs菌落明场显微图像中对应位置标记质量佳。
3.根据权利要求1所述检测早期iPSCs质量的方法,其特征在于,采用所述标记后iPSCs菌落明场显微图像对基于EfficientDet的目标检测模型进行训练,得到已训练目标检测模型的步骤包括:
将标记后iPSCs菌落明场显微图像划分为训练集图像和测试集图像,其中,训练集图像和测试集图像的数量比为7:3;
采用训练集图像对基于EfficientDet的目标检测模型进行训练,得到已训练目标检测模型。
4.根据权利要求3所述检测早期iPSCs质量的方法,其特征在于,采用训练集图像对基于EfficientDet的目标检测模型进行训练之前包括步骤:
手动筛选和过滤出跨界单元区域小于预设区域的细胞。
5.根据权利要求3所述检测早期iPSCs质量的方法,其特征在于,采用训练集图像对基于EfficientDet的目标检测模型进行训练的步骤中,通过对所述训练集图像进行旋转角度、调整饱和度、调整曝光或调整色调生成更多训练集图像。
6.根据权利要求1所述检测早期iPSCs质量的方法,其特征在于,所述基于EfficientDet的目标检测模型包括EfficientNets主干网络、双向特征金字塔网络BiFPN以及类/边界框网络。
7.根据权利要求6所述检测早期iPSCs质量的方法,其特征在于,所述双向特征金字塔网络BiFPN集成了双向跨尺度连接和快速归一化融合,其输出公式为:和其中,w1为学习权重,是自上而下路径中,第6级的中间特征,而是自下而上路径中,第六级的输出特征。
8.一种存储介质,其特征在于,所述存储介质存储有一个或者多个程序,所述一个或者多个程序可被一个或者多个处理器执行,以实现如权利要求1-7任意一项所述检测早期iPSCs质量的方法中的步骤。
9.一种检测早期iPSCs质量的装置,其特征在于,包括处理器,适于实现各指令;以及存储介质,适于存储多条指令,所述指令适于由处理器加载并执行权利要求1-7任意一项所述检测早期iPSCs质量的方法中的步骤。
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