[发明专利]一种与细毛羊羊毛性状相关的SNP标记及其检测引物组、试剂盒、检测方法和应用有效
申请号: | 202110262812.3 | 申请日: | 2021-03-11 |
公开(公告)号: | CN112921102B | 公开(公告)日: | 2021-10-26 |
发明(设计)人: | 蒋琳;马月辉;梁奔梦;白添友;赵玉和田 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 吕永齐 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细毛羊 羊毛 性状 相关 snp 标记 及其 检测 引物 试剂盒 方法 应用 | ||
1.检测SNP分子标记的引物组或者检测SNP分子标记的试剂盒在羊毛粗细性状相关的绵羊的分子标记辅助育种中的应用;
所述SNP分子标记位于绵羊第3号染色体第61927840bp位点;所述位点上存在T/C碱基突变,“TT”是细毛羊品种的优势基因型,而“CC”和“TC”是粗毛羊品种中的基因型;所述SNP分子标记基于绵羊基因组序列信息版本号Oar_v4.0,2015年11月;
所述引物组,包括正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;
所述试剂盒包括所述的引物组。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、Phanta MaxSuper-Fidelity DNA聚合酶和PCR反应缓冲液。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述试剂盒还包括标准阳性模板。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述应用包括以下步骤:
1)提取待测绵羊的基因组DNA;
2)以待测绵羊的基因组DNA为模板,利用所述引物组进行PCR扩增反应,获得PCR扩增产物;
3)检测所述PCR扩增产物的第120bp处的基因型,得到所述SNP位点的基因型。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增反应的体系以25μl计包括以下组分:待测绵羊的基因组DNA 1μl,正向引物和反向引物各1μl,dNTP mix 0.5μl,Phanta Max Super-Fidelity DNA聚合酶0.5μl,2×PCR反应缓冲液12.5μl和余量的双蒸水;
所述待测绵羊的基因组DNA的浓度为50~100ng/μl;所述正向引物和反向引物的浓度分别为10pmol/μl;所述dNTP mix的浓度为10mmol/L。
6.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增反应的程序为:95℃预变性5min;95℃变性30 s,63℃退火30 s,72℃延伸2min,共34个循环;72℃保温2min。
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