[发明专利]一种检测DNA羟化酶TET1的纳米传感器及其检测方法和应用有效
申请号: | 202110261946.3 | 申请日: | 2021-03-10 |
公开(公告)号: | CN113151402B | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 张春阳;胡娟;姚洁;潘丽媛 | 申请(专利权)人: | 山东师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6818 | 分类号: | C12Q1/6818;C12Q1/6825;C12Q1/48;C12Q1/26 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 王磊 |
地址: | 250014 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 dna 羟化酶 tet1 纳米 传感器 及其 方法 应用 | ||
1.一种纳米传感器在制备检测DNA羟化酶TET1活性的试剂盒中的应用,其特征是,一种检测DNA羟化酶TET1的试剂盒包括纳米传感器、尿苷二磷酸葡萄糖、缓冲溶液;所述检测DNA羟化酶TET1的纳米传感器包括发夹探针、T4噬菌体β-葡萄糖基转移酶、内切酶、量子点;
所述发夹探针为能够形成茎环结构的单链DNA,所述发夹探针的一端连接荧光剂,另一端能够与量子点配合连接,形成茎环结构的茎区域含有被内切酶识别并剪切的位点,所述位点含有5-甲基胞嘧啶;
量子点与荧光剂能够配合发生荧光共振能量转移;
所述荧光剂为Cy5,所述量子点为605QD;所述内切酶为内切酶MspI;
发夹探针通过生物素-链霉亲和素与量子点连接;发夹探针连接生物素,量子点表面包被链霉亲和素;
发夹探针形成茎环结构后,能够连接量子点的一端突出;
发夹探针的序列为:
TTT TTC ACT CmCG GTC ACG TTT TCG TGA CCG GAG TG,其中,mC为甲基胞嘧啶。
2.一种DNA羟化酶TET1活性的检测方法,其特征是,提供权利要求1所述的检测DNA羟化酶TET1的纳米传感器;步骤如下:
TET1的测定:首先,检测探针与含有5mM MgCl2、10mM Tris-HCl,且pH为8.0的缓冲液A在95℃下孵育5min,缓慢冷却至室温;然后,在含有50mM HEPES、50mM NaCl、75μM Fe(NH4)2(SO4)2、2mM抗坏血酸、2.5mM DTT和1mMα-KG的反应液中加入144nM检测探针和不同浓度的TET1,37℃反应30min;第三,反应产物与40μM尿苷二磷酸葡萄糖和3U T4噬菌体β-葡萄糖基转移酶和含有50mM醋酸钾、20mM Tris-Ac、10mM醋酸镁、1mM DTT,且pH为7.9的缓冲液B组成反应溶液,37℃孵育2h;随后,糖基化产物与30U MspI和含有10mM醋酸镁、20mM Tris-Ac、50mM醋酸钾、0.1mg/mL BSA,且pH为7.9的缓冲液C组成反应溶液,37℃消化2h;最后,将消化后的产物加入0.5nM 605QDs和含有100mM Tris-HCl、10mM(NH4)2SO4、3mM MgCl2,且pH为8.0的60μl缓冲液D中,室温孵育20min,得到605QD-DNA-Cy5纳米结构;
TET1测定的检测探针为5’-biotin-TTT TTC ACT CmCG GTC ACG TTT TCG TGA CCG GAGTG-Cy5-3’,其中,mC为甲基胞嘧啶;
凝胶电泳分析:MspI的消化产物与荧光指示剂混合加入12%的聚丙烯酰胺凝胶中,凝胶放入三羟甲基氨基甲烷-硼酸中,在110V恒压室温条件下电泳40min;多通道成像由ChemiDoc MP成像系统完成。SYBR Gold信号使用460-490nm激发的Epi-blue和518-546nm滤光片进行测量,Cy5信号使用625-650nm激发的Epi-red和675-725nm滤光片进行测量;
荧光检测:荧光光谱由荧光分光光度计在488nm的激发波长下进行检测;
所述检测方法不以疾病的诊断和治疗为目的。
3.一种权利要求1所述的试剂盒在筛选DNA羟化酶TET1药物中的应用,其特征是,所述应用不以疾病的诊断和治疗为目的。
4.如权利要求3所述的应用,其特征是,所述DNA羟化酶TET1药物为TET1抑制剂。
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