[发明专利]一种用于检测药物代谢相关SNP位点的引物组及其方法在审
| 申请号： | 202110260045.2 | 申请日： | 2021-03-10 |
| 公开（公告）号： | CN112831557A | 公开（公告）日： | 2021-05-25 |
| 发明（设计）人： | 梅艳巧;谢桂贞;陈佳颖;杨帆;王博 | 申请（专利权）人： | 上海浦东解码生命科学研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6883 | 分类号： | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 上海愉腾专利代理事务所(普通合伙) 31306 | 代理人： | 唐海波 |
| 地址： | 200136 上海*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 用于 检测 药物 代谢 相关 snp 引物 及其 方法 | ||
1.一种用于检测药物代谢相关SNP位点的引物组，其特征在于，所述药物代谢相关SNP位点包括：12s rRNA、rs267606617、rs1876828、rs4244285、rs4986893、rs1799853、rs1057910、rs1065852、rs776746、rs37973、rs3909184、rs2844682、rs730012、rs3812718；所述引物组序列如SEQ ID NO.1～28。
2.根据权利要求1所述的一种用于检测药物代谢相关SNP位点的引物组，其特征在于，所述引物组还包括SEQ ID NO.29～42所示的14个单碱基延伸引物。
3.一种用于检测药物代谢相关SNP位点的方法，其特征在于，所述用于检测药物代谢相关SNP位点的方法包括以下步骤：
合成引物序列：合成权利要求1至2任一所述的用于检测药物代谢相关SNP位点的引物组；
多重PCR扩增SNP位点基因片段：将合成的引物组通过多重PCR扩增体系一次扩增覆盖所述用于检测药物代谢相关SNP位点的个性化用药基因片段；
单碱基延伸SNP位点：通过多重单碱基延伸体系一次延伸个性化用药基因的SNP位点；
上机检测基因型：通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱方法，检测数据并分析各突变位点的基因型。
4.根据权利要求3所述的一种用于检测药物代谢相关SNP位点的方法，其特征在于：所述方法还包括虾碱性磷酸酶消化反应的步骤，多重PCR扩增SNP位点基因片段后进行虾碱性磷酸酶消化反应，进行了虾碱性磷酸酶消化反应后再进行单碱基延伸SNP位点。
5.根据权利要求3所述的一种用于检测药物代谢相关SNP位点的方法，其特征在于：所述多重PCR扩增体系为一个混合多种成分在单个孔内的扩增反应体系。
6.根据权利要求3所述的一种用于检测药物代谢相关SNP位点的方法，其特征在于：所述多重PCR扩增体系所需的试剂包括Nuclease-Free Water、10×PCR Buffer、MgCl2、dNTPMix、PCR扩增引物Mix、基因组DNA和PCR Enzyme。
7.根据权利要求3所述的一种用于检测药物代谢相关SNP位点的方法，其特征在于：所述多重单碱基延伸体系所需的试剂包括Nuclease-Free Water、iPLEX Buffer Plus、iPLEXTermination mix、单碱基延伸引物Mix和iPLEX Enzyme。
8.根据权利要求4所述的一种用于检测药物代谢相关SNP位点的方法，其特征在于：所述虾碱性磷酸酶消化反应所需的试剂包括Nuclease-Free Water、SAP Buffer和ShrimpAlkal ine Phosphatase Enzyme。
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