[发明专利]一种鼓槌石斛SSR分子标记引物组合物及其应用

说明书

本发明提供了一种鼓槌石斛SSR分子标记引物组合物及其应用，属于分子生物学技术领域。本发明从鼓槌石斛转录组序列中，开发并筛选出扩增效果好、多态性高的25对SSR分子标记引物，采用所述的SSR分子标记引物，可对鼓槌石斛群体的遗传多样性及亲缘关系进行分析，也可对鼓槌石斛无性系或品种进行种质鉴定和亲缘关系分析，具有高效、准确、实用、不受季节影响等优点，为后续鼓槌石斛种质资源管理、育种、遗传保护、群体间和群体内的遗传多样性分析等奠定了基础。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种鼓槌石斛SSR分子标记引物组合物及其应用。

背景技术

鼓槌石斛(Dendrobiumchrysotoxum)为兰科石斛属多年附生草本植物，是集观赏、食、药为一体且栽培较广的石斛种类之一，被收录于2020年版《中国药典》。其茎、花晾干后泡水喝，具有美容明目、安神补血、抗氧化和增强免疫力等功效。同时，鼓槌石斛茎肉质纺锤形，叶四季常绿，花金黄色，花量大，稍带香气，花期长达1个月，具有较高的观赏价值，可作大小盆栽、垂直悬挂、附生石块上或树枝上等多样栽培和应用。鼓槌石斛原产于我国西南地区，生于海拔500-1600m，阳光充足的常绿阔叶林中树干上或疏林下岩石上，国外分布于印度东北部、缅甸、泰国、老挝和越南。

SSR分子标记具有使用简便、快速、稳定性高、等位基因多样性高以及可做共显性的等位基因分析等特点，目前已成为一种主要的分子标记技术，被广泛应用于植物遗传多样性分析、群体结构分析、品种鉴定和种质资源亲缘关系分析等多方面研究领域。如沈颖等采用ISSR-PCR的方法对石斛属9种植物进行鉴别，包括美花石斛、束花石斛、叠鞘石斛、鼓槌石斛、细叶石斛、罗河石斛、球花石斛、玫瑰石斛和铁皮石斛(沈颖,徐程,万小凤,等.ISSR-PCR在石斛种间鉴别中的应用[J].中草药,2005,36(3):423-427.)。专利CN104313162A则公开了一种用于鉴别鼓槌石斛和球花石斛的分子特异性标记引物及其方法。

近年来，在铁皮石斛、金钗石斛等石斛属植物上开发了大量的SSR引物，但同属的鼓槌石斛则尚未有开发的SSR引物的报道，其遗传变异分析仍采用RAPD等分析标记，例如Tikendra等(2019)利用12对RAPD引物和11对ISSR引物评估了组培过程中鼓槌石斛克隆苗的遗传稳定性，发现克隆苗与母株间较高的遗传单态性(96.3％)和较低的多态性(3.6％)。鼓槌石斛作为一种观赏兼药用的植物，目前生产上尚未见通过审定且广泛栽培的鼓槌石斛品种，生产上主要利用其野生资源或组培无菌播种获得的实生苗或克隆苗，而对这些鼓槌石斛种质资源进行鉴定、保育及开发利用也越来越受到各界的重视。

因此，寻找并开发适用于鼓槌石斛遗传研究的SSR引物是进一步开展鼓槌石斛种质资源管理、遗传、保护等研究的前提基础。

发明内容

针对上述不足，本发明提供了一种鼓槌石斛SSR分子标记引物组合物及其应用。本发明筛选出在鼓槌石斛中扩增效果好，多态性高的25对SSR分子标记引物，采用所述的SSR分子标记引物，可对鼓槌石斛群体的遗传多样性及亲缘关系进行分析，也可对鼓槌石斛无性系或品种进行种质鉴定和亲缘关系分析，具有高效、准确、实用、不受季节影响等优点，为后续鼓槌石斛种质资源管理、育种、遗传保护、群体间和群体内的遗传多样性分析等奠定了基础。

为了实现上述发明目的，本发明的技术方案如下：

一方面，本发明提供了一种鼓槌石斛SSR分子标记引物组合物。

具体地，所述的引物组合物如下表1所示：

表1.引物组合物

另一方面，本发明提供了一种鼓槌石斛种质鉴定、遗传多样性或亲缘关系分析的产品，所述的产品包含上述SSR分子标记引物组合物。

具体地，所述的产品为独立试剂或试剂盒。